背景:脂肪干细胞促进损伤修复的研究较多,但从脂肪干细胞来源外泌体角度出发、基于蛋白质组学及生物信息学技术对其进行研究尚属少见.目的:通过蛋白质组学及生物信息学技术,分析糖尿病下肢溃疡患者和健康成年人脂肪干细胞来源外泌体差异表达蛋白,以期筛选诊断及预后标志物.方法:试验组为2018年10月至2019年5月在空军军医大学第二附属医院整形烧伤科接受清创植皮的糖尿病下肢溃疡患者25例、对照组为同期接受吸脂术的健康成年人10名.制备脂肪干细胞、提取外泌体并进行鉴定,从两组中分别随机抽取3例进行蛋白组学研究:利用LFQ技术行蛋白质定量分析;使用clueGO(version 2.5.4)对差异表达蛋白行GO和Pathway分析;对差异蛋白进行了蛋白-蛋白间相互作用分析(数据库String,版本11.0,R软件clusterProfiler package,FDR<0.25).结果与结论:①共筛选出可定量差异表达蛋白231种,其中31种差异有显著性意义,试验组下调表达蛋白29种,上调表达蛋白2种;②差异蛋白与营养、代谢类疾病相关性高;差异表达蛋白所处的细胞位置集中在细胞外囊泡、血小板 α 颗粒;差异表达蛋白参与的生物学过程为凝血过程及脂质转运;差异蛋白的主要分子功能与酶抑制剂活性、肝素结合能力有关;③PPI和KEGG通路分析显示,试验组表达下调显著的ITGA2B、IT
作者:秦丹莹;张玉恒;李学拥;杨雯娴
来源:中国组织工程研究 2020 年 24卷 13期