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背景:大量研究发现“乳香-没药”是中药复方治疗膝骨关节炎的常用配伍药对,但其药理机制尚不明确.目的:利用网络药理学技术探讨“乳香-没药”作为中医临床治疗痹病的常用配伍药对治疗膝骨关节炎的作用靶点及其相关作用机制.方法:使用TCMSP中药系统药理学数据库与分析平台收集乳香、没药的化学成分,根据药物生物口服利用度≥30%,类药性≥0.18对乳香、没药可能的生物活性成分进行筛选,并通过蛋白质数据库(Uniprot)筛选出各活性成分可能存在的靶点.查询GeneCards、OMIM、TTD、DrugBank数据库挖掘膝骨关节炎相关基因靶点,将两者取交集后获取疾病-药物蛋白靶基因.将获得的关键靶点基因上传至STRING数据库计算分析,筛选出重要的关键基因构建蛋白质间相互作用网络,构建PPI网络图.采用Cytoscape软件绘制药物-靶点和疾病-靶点可视化网络图,并进一步借助DAVID在线工具进行GO分析和KEGG通路富集分析.结果 与结论:①获得乳香生物活性成分8个,没药生物活性成分45个,同时检测出乳香、没药药物靶点蛋白412个,膝骨关节炎相关基因1 889个,药物与疾病共有靶点105个;②蛋白互作网络发现AKT1、TP53、IL6、TNF、JUN、MAPK1等可能是“乳香-没药”治疗膝骨关节炎的关键靶点;③富集分析确定了66个GO条目,涉及到细胞对缺氧的反应

作者:曹旭含;白子兴;孙承颐;杨艳军;孙卫东

来源:中国组织工程研究 2021 年 25卷 5期

知识库介绍

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作者:
曹旭含;白子兴;孙承颐;杨艳军;孙卫东
来源:
中国组织工程研究 2021 年 25卷 5期
标签:
膝 骨关节炎 乳香 没药 网络药理学 通路 蛋白 基因 机制
背景:大量研究发现“乳香-没药”是中药复方治疗膝骨关节炎的常用配伍药对,但其药理机制尚不明确.目的:利用网络药理学技术探讨“乳香-没药”作为中医临床治疗痹病的常用配伍药对治疗膝骨关节炎的作用靶点及其相关作用机制.方法:使用TCMSP中药系统药理学数据库与分析平台收集乳香、没药的化学成分,根据药物生物口服利用度≥30%,类药性≥0.18对乳香、没药可能的生物活性成分进行筛选,并通过蛋白质数据库(Uniprot)筛选出各活性成分可能存在的靶点.查询GeneCards、OMIM、TTD、DrugBank数据库挖掘膝骨关节炎相关基因靶点,将两者取交集后获取疾病-药物蛋白靶基因.将获得的关键靶点基因上传至STRING数据库计算分析,筛选出重要的关键基因构建蛋白质间相互作用网络,构建PPI网络图.采用Cytoscape软件绘制药物-靶点和疾病-靶点可视化网络图,并进一步借助DAVID在线工具进行GO分析和KEGG通路富集分析.结果 与结论:①获得乳香生物活性成分8个,没药生物活性成分45个,同时检测出乳香、没药药物靶点蛋白412个,膝骨关节炎相关基因1 889个,药物与疾病共有靶点105个;②蛋白互作网络发现AKT1、TP53、IL6、TNF、JUN、MAPK1等可能是“乳香-没药”治疗膝骨关节炎的关键靶点;③富集分析确定了66个GO条目,涉及到细胞对缺氧的反应