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背景:有研究表明金银花、黄连中多种单体治疗关节假体周围感染有效,关于金银花、黄连单独作用的研究较多,但金银花-黄连的共同药理作用机制鲜有文献报道.目的:基于分子对接和网络药理学手段探究金银花-黄连治疗关节假体周围感染的潜在有效成分、靶点和作用机制.方法:通过传统中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选金银花、黄连的有效成分和靶点基因.使用人类基因数据库(GeneCards)和在线孟德尔遗传数据库(OMIM)获得关节假体周围感染靶点基因,取交集后获得金银花-黄连与关节假体周围感染的交集基因.通过STRING数据库构建靶点蛋白质之间相互作用(PPI)网络,利用Cytoscape 3.7.2软件中"CytoNCA"插件对该PPI网络做拓扑分析和核心靶点筛选,再通过Cytoscape 3.7.2软件构建"中药-有效成分-交集靶点-疾病""有效成分-交集靶点"和"通路-富集基因"网络.利用DAVID在线工具进行交集靶点的基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并通过分子对接验证有效成分与靶点亲和力.结果与结论:①通过数据库筛选获得金银花治疗关节假体周围感染的有效成分14个及对应靶点183个,黄连治疗关节假体周围感染的有效成分9个及对应靶点158个;②共获得关节假体周围感染相关基因286个,药物和疾病的交集基因37

作者:张海涛;陈锦伦;朱兴阳;曾会粮;李杰;孙小波;齐新宇;曾建春;曾意荣

来源:中国组织工程研究 2021 年 25卷 21期

知识库介绍

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张海涛;陈锦伦;朱兴阳;曾会粮;李杰;孙小波;齐新宇;曾建春;曾意荣
来源:
中国组织工程研究 2021 年 25卷 21期
标签:
关节 中医药 假体 金银花 黄连 感染 网络药理学 分子对接 信号通路 基因
背景:有研究表明金银花、黄连中多种单体治疗关节假体周围感染有效,关于金银花、黄连单独作用的研究较多,但金银花-黄连的共同药理作用机制鲜有文献报道.目的:基于分子对接和网络药理学手段探究金银花-黄连治疗关节假体周围感染的潜在有效成分、靶点和作用机制.方法:通过传统中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选金银花、黄连的有效成分和靶点基因.使用人类基因数据库(GeneCards)和在线孟德尔遗传数据库(OMIM)获得关节假体周围感染靶点基因,取交集后获得金银花-黄连与关节假体周围感染的交集基因.通过STRING数据库构建靶点蛋白质之间相互作用(PPI)网络,利用Cytoscape 3.7.2软件中"CytoNCA"插件对该PPI网络做拓扑分析和核心靶点筛选,再通过Cytoscape 3.7.2软件构建"中药-有效成分-交集靶点-疾病""有效成分-交集靶点"和"通路-富集基因"网络.利用DAVID在线工具进行交集靶点的基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并通过分子对接验证有效成分与靶点亲和力.结果与结论:①通过数据库筛选获得金银花治疗关节假体周围感染的有效成分14个及对应靶点183个,黄连治疗关节假体周围感染的有效成分9个及对应靶点158个;②共获得关节假体周围感染相关基因286个,药物和疾病的交集基因37