背景:骨关节炎是老年人中常见的慢性疾病之一,目前还没有有效的治疗方法.目的:鉴定骨关节炎滑膜组织中的差异表达基因和相关信号通路,阐明骨关节炎的发病机制并寻找有效的药物靶点.方法:①从GEO数据库中收集10个相关数据集,包括120个骨关节炎患者滑膜组织样本和85个正常人滑膜组织样本,鉴定出差异表达基因;②对这些差异表达基因进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,使用Cytoscape软件构建差异表达基因的蛋白质-蛋白质相互作用网络,并进行了模块分析,筛选关键基因;③通过Drugbank数据库筛选获准的用于治疗骨关节炎的药物,Drug Gene Interaction数据库挖掘这些药物的靶基因.结果与结论:①文章总共鉴定出25个差异表达基因,包括20个上调的差异表达基因(SPP1、基质金属蛋白酶1及基质金属蛋白酶9等)和5个下调的差异表达基因(APOD、FKBP5及ZBTB16等);②GO功能富集分析结果表明,这些差异表达基因主要参与细胞外基质的代谢(例如胶原分解代谢过程、细胞外基质分解、胶原代谢过程、细胞外结构组织和蛋白质代谢过程);③KEGG富集分析结果表明,差异表达基因主要富集在"白细胞介素17信号通路"和"类风湿关节炎";④通过Drugbank数据库和Drug Gene Interaction数据库共挖掘出50种获得批准的治疗骨关节炎药物及对应的209个
作者：刘金富；曾平；农焦；范思奇；冯程钦；黄佳兴
来源：中国组织工程研究 2021 年 25卷 23期
