目的 通过基因芯片技术及生物信息学方法筛选潜在的膀胱癌生物标记物.方法 收集3对肌浸润性膀胱癌组织和正常膀胱上皮组织提取总RNA并行基因芯片杂交检测,获得差异表达基因进行相关生物信息学分析及验证.结果 按设定的标准,共获得下调基因516个,上调基因32个;基因本体(GO)功能富集显示差异基因主要参与细胞生长与维持、细胞通讯、信号传导等;京都基因与基因组百科全书通路(KEGG pathway)富集发现这些基因涉及的通路与上皮间质转化、磷脂通路等相关;通过蛋白互作网络进一步筛选出11个核心基因,TCGA肿瘤数据库验证11个核心基因在膀胱癌表达均降低.结论 本研究筛选出11个可能作为膀胱癌潜在生物标记的候选基因,为后续膀胱癌研究提供有价值的线索.
作者:成松桃;陈亮;王行环
来源:现代泌尿外科杂志 2017 年 22卷 12期