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目的 探讨新型H1N1流感病毒从2009年在苏州出现至2011年基本消失的整个过程中,苏州分离株的神经氨酸酶(Neuraminidase,NA)的分子特征及其基因变异和发展规律.方法 提取苏州分离株的RNA,以WHO推荐的引物扩增NA基因并测序.以WHO推荐的季节性H1N1和新型H1N1疫苗株为参照,采用生物信息学软件对苏州毒株的NA进行详细的分子特征分析,并与全球及全国的代表性毒株进行序列进化分析.结果 与疫苗株相比,5株苏州株的核苷酸序列同源性均值为99.64%,氨基酸序列同源性均值为99.36%.5株苏州株中都没有发现抗原位点的改变,但4株在耐药性相关位点附近出现N248D突变,还有1株2011年株增加了1个新的潜在糖基化位点.结论 首次详细分析了苏州地区2009年以来H1N1型流感病毒NA的分子特征,表明苏州毒株出现了一个新的潜在糖基化位点,但抗原性和药物敏感性均保持稳定.

作者:韩卫宁;夏瑜;雅雪蓉;沈强;潘浩;沈洁

来源:现代预防医学 2013 年 40卷 6期

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作者:
韩卫宁;夏瑜;雅雪蓉;沈强;潘浩;沈洁
来源:
现代预防医学 2013 年 40卷 6期
标签:
甲型流感病毒 新型H1N1 神经氨酸酶 遗传特征
目的 探讨新型H1N1流感病毒从2009年在苏州出现至2011年基本消失的整个过程中,苏州分离株的神经氨酸酶(Neuraminidase,NA)的分子特征及其基因变异和发展规律.方法 提取苏州分离株的RNA,以WHO推荐的引物扩增NA基因并测序.以WHO推荐的季节性H1N1和新型H1N1疫苗株为参照,采用生物信息学软件对苏州毒株的NA进行详细的分子特征分析,并与全球及全国的代表性毒株进行序列进化分析.结果 与疫苗株相比,5株苏州株的核苷酸序列同源性均值为99.64%,氨基酸序列同源性均值为99.36%.5株苏州株中都没有发现抗原位点的改变,但4株在耐药性相关位点附近出现N248D突变,还有1株2011年株增加了1个新的潜在糖基化位点.结论 首次详细分析了苏州地区2009年以来H1N1型流感病毒NA的分子特征,表明苏州毒株出现了一个新的潜在糖基化位点,但抗原性和药物敏感性均保持稳定.