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目的 对2007~2009年度南宁市流行性感冒的病原学监测结果进行分析,了解南宁市H3N2亚型人流感病HA1基因变异规律和进化趋势.方法 随机选择2007~2009年流感病原学监测中分离到的H3N2亚型毒株30株(每年10株),提取病毒RNA,采用RT-PCR扩增病毒HA基因后进行核苷酸序列测定,利用VectorNTI 9.0对测序结果进行分析处理,并与WHO推荐疫苗株进行比对,用Mage 4.1构建系统进化树.结果 HA1氨基酸序列的系统进化树表明,南宁市2007~2009年H3N2亚型人流感病毒株被分为4个分枝,大多数2007、2008年毒株与疫苗株交叉分布于分支Ⅰ和Ⅱ,2009年毒株独立形成一个分支Ⅳ.2007年388、390、406毒株HA1发生了一个氨基酸的插入,其他毒株序列则比较保守.与疫苗株相比,2007~2009年毒株HA1二硫键和受体结合位点(RBS)位点高度保守,而糖基化位点、抗原决定簇位点均发生了不同程度的变异.结论 南宁市2007年与2008年H3N2流感病毒HA1基因特性与疫苗株接近,2009年毒株发生了较大变异.WHO推荐的当年疫苗株均滞后南宁流行株.

作者:范云燕;刘海燕;林新勤;秦剑秋;黄莉

来源:现代预防医学 2013 年 40卷 9期

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作者:
范云燕;刘海燕;林新勤;秦剑秋;黄莉
来源:
现代预防医学 2013 年 40卷 9期
标签:
甲型流感病毒 H3N2 血凝素 基因特性
目的 对2007~2009年度南宁市流行性感冒的病原学监测结果进行分析,了解南宁市H3N2亚型人流感病HA1基因变异规律和进化趋势.方法 随机选择2007~2009年流感病原学监测中分离到的H3N2亚型毒株30株(每年10株),提取病毒RNA,采用RT-PCR扩增病毒HA基因后进行核苷酸序列测定,利用VectorNTI 9.0对测序结果进行分析处理,并与WHO推荐疫苗株进行比对,用Mage 4.1构建系统进化树.结果 HA1氨基酸序列的系统进化树表明,南宁市2007~2009年H3N2亚型人流感病毒株被分为4个分枝,大多数2007、2008年毒株与疫苗株交叉分布于分支Ⅰ和Ⅱ,2009年毒株独立形成一个分支Ⅳ.2007年388、390、406毒株HA1发生了一个氨基酸的插入,其他毒株序列则比较保守.与疫苗株相比,2007~2009年毒株HA1二硫键和受体结合位点(RBS)位点高度保守,而糖基化位点、抗原决定簇位点均发生了不同程度的变异.结论 南宁市2007年与2008年H3N2流感病毒HA1基因特性与疫苗株接近,2009年毒株发生了较大变异.WHO推荐的当年疫苗株均滞后南宁流行株.