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目的 了解厦门市结核分枝杆菌基因类型分布及主要流行基因群情况,并建立分型数据库.方法 采用实时荧光PCR法对厦门市2013-2015年分离到的466株结核分枝杆菌临床分离株进行菌株确认,然后采用间隔区寡核苷酸分型方法(spoligotyping)对其进行基因分型.分型结果与SpolDB4数据库进行比对,并使用Bionumeric6.6.4软件进行基因聚类分析.结果 466株菌均为结核分枝杆菌,基因分型分成96种基因型别,62种数据库中有相应的SIT编号,34种为新的型别.97.64%(455/466)的菌构成了15个基因簇.466株菌属于7个基因家族及未定义家族,排在前三的分别为:Beijing(北京)家族60.09%(280/466)、T家族21.03%(98/466)、H家族5.58%(26/466).结论 厦门市结核分枝杆菌基因型别呈现多样性,北京家族为主要的流行基因群.

作者:张建梅;郑蓉蓉;曾小红;翁琴云;黄建炜;牛建军

来源:现代预防医学 2016 年 43卷 22期

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作者:
张建梅;郑蓉蓉;曾小红;翁琴云;黄建炜;牛建军
来源:
现代预防医学 2016 年 43卷 22期
标签:
实时荧光PCR 结核分枝杆菌 北京家族 基因分型 间隔区寡核苷酸分型 Real-time PCR Mycobacterium tuberculosis Beijing family Genotype Spoligotyping
目的 了解厦门市结核分枝杆菌基因类型分布及主要流行基因群情况,并建立分型数据库.方法 采用实时荧光PCR法对厦门市2013-2015年分离到的466株结核分枝杆菌临床分离株进行菌株确认,然后采用间隔区寡核苷酸分型方法(spoligotyping)对其进行基因分型.分型结果与SpolDB4数据库进行比对,并使用Bionumeric6.6.4软件进行基因聚类分析.结果 466株菌均为结核分枝杆菌,基因分型分成96种基因型别,62种数据库中有相应的SIT编号,34种为新的型别.97.64%(455/466)的菌构成了15个基因簇.466株菌属于7个基因家族及未定义家族,排在前三的分别为:Beijing(北京)家族60.09%(280/466)、T家族21.03%(98/466)、H家族5.58%(26/466).结论 厦门市结核分枝杆菌基因型别呈现多样性,北京家族为主要的流行基因群.