目的 利用生物信息学方法筛选乳腺癌脑转移瘤差异表达的核心基因.方法 从GEO数据库下载GSE125989数据集,运用GEO在线分析工具GEO2R分析数据集的差异基因.利用在线工具DAVID对差异表达基因进行GO功能注释和KEGG通路富集分析,将获得的差异表达基因数据输入STRING数据库并通过Rstudio进行可视化.利用Rstudio的CytoHubba插件筛选核心基因.利用Kaplan-Meier Plotter在线工具验证核心基因与总生存期的关系.结果 经GEO2R工具筛选出22 277个基因,进一步筛选集中获得差异表达基因74个,GO功能注释发现,差异表达基因主要在细胞外基质组织等方面显著富集;KEGG通路主要在蛋白质消化吸收等通路富集.通过CytoHubba插件以度筛选出PPI网络中排名前10位的差异表达基因为核心基因.生存分析显示DCN、ELN与患者总生存期具有显著的相关性.结论 本研究共筛选出2个与乳腺癌脑转移预后相关的核心基因,分别为DCN、ELN.
作者：吴双丽；徐敬宣；邢龙
来源：现代医药卫生 2023 年 39卷 18期
