目的 探讨银屑病患者与健康人群肠道菌群多样性的差异.方法 收集2017年5月至2018年6月间在中国医学科学院皮肤病研究所住院治疗的银屑病患者(银屑病组)及同期本院健康体检人群(健康组)的新鲜粪便标本,分析受试者相关临床资料.提取肠道菌群DNA,采用16S rDNA基因扩增和Illumina平台双端2×300策略测序,基于Gold数据库按>97%的相似性聚类操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU),对照Silva数据库进行物种注释及分类,各层级样本采用轶和检验分析物种差异;QIIME软件计算α多样性主要指数、 β多样性分析,t检验分析指数差异,P<0.05为差异有统计学意义.相关研究结果通过R及GraphPad Prism作图展示.结果 符合入选和排除标准的11例银屑病患者及21例健康对照者入选本研究,两组研究对象的性别构成比、 年龄和体质量指数无统计学差异(P均>0.05).DNA测序分析显示样本测序覆盖深度>0.99.银屑病组肠道菌群的OTU数量(278.18±89.75比722.95±152.81,t=10.36,P<0.01)、 赵氏指数(433.38±147.47比1156.08±292.50,t=9.291,P<0.01)、 香农指数(3.56±0.87比5.73±0.78,t=6.972,P<0.01)和辛普森指数(0.79±0.15比0.94±0.04,t=3.287,P<0.01)均显著低于健康组.Rank-Abundance曲线显示银屑病组肠道菌群均匀程度较低.PCo
作者:王丽玮;段志敏;童建波;曾荣;徐浩翔;李岷
来源:协和医学杂志 2019 年 10卷 3期