目的 风疹病毒(Rubella virus,RV)是先天性风疹综合征(先天性心脏病、先天性白内障和耳聋的三联综合征)的致病因素,本研究针对RV全基因组序列的生物信息学特点,设计RV 60-mer长链寡核苷酸探针,探讨寡核苷酸探针和功能基因芯片的设计方法.方法 利用生物信息学软件Array Designer 2.0针对RV全基因组设计Tm值相近、长度均一的60-mer探针,利用其BLAST功能将所得探针在GenBank数据库进行序列比对分析,筛选得到RV特异性Oligo探针并设计成功能基因芯片.结果 获得11条60-mer Oligo探针,用于打印成DNA芯片,拟用于RV检测与病毒基因表达功能分析.结论 利用Array Designer 2.0软件设计芯片探针比常见其他方法更有效,尤其适合于病毒检测和病毒基因功能分析复合型芯片的设计.
作者：莫小阳；马文丽；张亚莉；赵海全；郑文岭
来源：心脏杂志 2006 年 18卷 6期
