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TNFSF4(Tumor necrosis factor superfamily,number4)基因是动脉粥样硬化的易感基因.但在瑞典、德国人群中进行的病例对照关联分析却得到了相反的结果.为探讨中国汉族人群中该基因与冠心病的关联性,从山东大学齐鲁医院选取了498例病例及509例对照,分析了TNFSF4基因上5个SNP位点(rs1234314、rs45454293、rs3850641、rs1234313,rs3861950)与冠心病之间的关联性.在采用传统的以单个SNP位点为单位以及以单体型为单位的统计分析方法的基础上,引进基于主成分的logistic回归分析方法进行处理.结果显示:Armitage趋势检验中只有rs3861950位点(P=0.0324)具有统计学意义,经Bonferroni多重检验校正后,5个SNP位点均无统计学意义;调整混杂因素的logistic回归分析中,5个SNP位点均无统计学意义;单体型分析中,CTAGT(P=0.0006)、CTAAC(P=0.0123)、CCAGT(P=0.0004)、GTGGT(P=0.0329)、GCGAC(P<0.0001)以及GCAAC(P=0.0173)这6个单体型在病例组和对照组中的频率差异具有统计学意义;基于主成分的logistic回归分析中,第一主成分具有统计学意义(P:0.0236).结果表明,TNFSF4基因与冠心病之间存在关联性.

作者:陈民志;程广辉;马龙;王慧;邱熔芳;薛付忠;刘奇迹

来源:遗传 2011 年 33卷 3期

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作者:
陈民志;程广辉;马龙;王慧;邱熔芳;薛付忠;刘奇迹
来源:
遗传 2011 年 33卷 3期
标签:
TNFSF4基因 冠心病 主成分分析 logistic回归分析 关联分析
TNFSF4(Tumor necrosis factor superfamily,number4)基因是动脉粥样硬化的易感基因.但在瑞典、德国人群中进行的病例对照关联分析却得到了相反的结果.为探讨中国汉族人群中该基因与冠心病的关联性,从山东大学齐鲁医院选取了498例病例及509例对照,分析了TNFSF4基因上5个SNP位点(rs1234314、rs45454293、rs3850641、rs1234313,rs3861950)与冠心病之间的关联性.在采用传统的以单个SNP位点为单位以及以单体型为单位的统计分析方法的基础上,引进基于主成分的logistic回归分析方法进行处理.结果显示:Armitage趋势检验中只有rs3861950位点(P=0.0324)具有统计学意义,经Bonferroni多重检验校正后,5个SNP位点均无统计学意义;调整混杂因素的logistic回归分析中,5个SNP位点均无统计学意义;单体型分析中,CTAGT(P=0.0006)、CTAAC(P=0.0123)、CCAGT(P=0.0004)、GTGGT(P=0.0329)、GCGAC(P<0.0001)以及GCAAC(P=0.0173)这6个单体型在病例组和对照组中的频率差异具有统计学意义;基于主成分的logistic回归分析中,第一主成分具有统计学意义(P:0.0236).结果表明,TNFSF4基因与冠心病之间存在关联性.