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茸角是鹿科动物特有的器官,具有重要的生物学意义.鹿茸生长是一个复杂的生物代谢过程,其重量与遗传因素有一定关联.本研究对饲养条件基本一致的5个梅花鹿(Cervus nippon)群体进行调查,获得高产和低产梅花鹿个体共100只,利用全基因组重测序分析这些个体与鹿茸重量相关的遗传变异.结果表明,共得到94个与鹿茸重量可能相关的遗传变异,其中有2个变异位点分别定位于OAS2和ALYREF/THOC4基因的外显子区,且ALYREF/THOC4基因在鹿茸中表达量很高.功能富集分析发现,这些遗传变异与鹿茸生长发育密切相关,可作为潜在的鹿茸重量相关遗传变异.本研究首次通过全基因组重测序直接筛选与鹿茸重量相关的遗传变异,并分析关联基因的生物学功能,对揭示鹿茸生长发育和鹿茸重量差异形成的遗传机制具有重要意义.

作者:胡鹏飞;徐佳萍;艾成;邵秀娟;王洪亮;董依萌;崔学哲;杨福合;邢秀梅

来源:遗传 2017 年 39卷 11期

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作者:
胡鹏飞;徐佳萍;艾成;邵秀娟;王洪亮;董依萌;崔学哲;杨福合;邢秀梅
来源:
遗传 2017 年 39卷 11期
标签:
全基因组重测序 梅花鹿 鹿茸重量 全基因组关联分析 whole genome re-sequencing Cervus nippon velvet antler weight genome wide association study
茸角是鹿科动物特有的器官,具有重要的生物学意义.鹿茸生长是一个复杂的生物代谢过程,其重量与遗传因素有一定关联.本研究对饲养条件基本一致的5个梅花鹿(Cervus nippon)群体进行调查,获得高产和低产梅花鹿个体共100只,利用全基因组重测序分析这些个体与鹿茸重量相关的遗传变异.结果表明,共得到94个与鹿茸重量可能相关的遗传变异,其中有2个变异位点分别定位于OAS2和ALYREF/THOC4基因的外显子区,且ALYREF/THOC4基因在鹿茸中表达量很高.功能富集分析发现,这些遗传变异与鹿茸生长发育密切相关,可作为潜在的鹿茸重量相关遗传变异.本研究首次通过全基因组重测序直接筛选与鹿茸重量相关的遗传变异,并分析关联基因的生物学功能,对揭示鹿茸生长发育和鹿茸重量差异形成的遗传机制具有重要意义.