为对比显性标记应用于居群遗传结构研究时不同统计参数的适用性，利用RAPD技术对中国5个居群的100个疣粒野生稻个体进行了遗传结构分析。在衡量居群遗传多样性水平时，多态位点比率（PPB）会低估遗传变异的量，其价值不如Shannon多样性指数和Nei基因多样性指数，而采用Nei指数时不必进行Lynch-Milligan矫正。对个体间遗传关系进行分析时，17种遗传相似性指数矩阵两两之间的Mantel检测都表现出极显著的相关性（r＞0.95,t＞t0.01),且UPGMA聚类图的模式基本相似。基于统计量（st）的分子方差分析（AMOVA）和基于Hardy-Weinberg平衡假设的Nei遗传距离分析结果具有显著相关性，它们都适合用于遗传结构分析，且应用后者时应通过Lynch-Milligan矫正减少显性遗传对变异估计偏低的影响，增加检测居群间遗传分化的能力。此外，AMOVA分析、Gst分析和Shannon多样性指数巢式分析都得出一致的结果，表明疣粒野生稻的遗传变异绝大部分存在于地区之间，而地区内和居群内的多样性程度较低。
作者：钱韦；葛颂
来源：遗传学报 2001 年 28卷 3期
