为研究鸡MHCB-LBⅡ基因的遗传多态性,首先在8个中国地方鸡种(藏鸡、仙居鸡、北京油鸡、固始鸡、斗鸡、丝羽乌骨鸡、白耳鸡和狼山鸡)B-LBⅡ基因第二外显子扩增了一长度为175 bp的DNA片段并进行SSCP基因型分析;在8个地方鸡种共467个个体中检测到37个PCR-SSCP基因型;从被检样品中筛选出不同基因型的个体,并在其B-LBⅡ基因组中扩增了一个包括其第二外显子和第二内含子在内长度为374bp的片段,通过克隆和测序获得了该片段的核苷酸序列.经序列分析,在前述地方鸡种被筛选出的30个无血缘关系的个体中发现了31个B-LBⅡ新等位基因,并参照哺乳动物MHCⅡ类B等位基因命名规则进行了命名.对这31个B-LBⅡ新等位基因长度为374bp的DNA片段进行比对表明,在其第二外显子序列上共有68个多态性变异位点,其中简约性信息位点51个,单变异位点17个,具有丰富的遗传多态性.在这些多态性变异位点中,出现在遗传密码子第一和第二位上的碱基替换率分别为36.76
作者:徐日福;李奎;陈国宏;徐慧;强巴央宗;李长春;刘榜
来源:遗传学报 2007 年 34卷 2期