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背景 哺乳动物视觉适应机制与其视皮质发育密切相关,在不同发育阶段的视皮质中,有不同生物学功能的多种基因参与视觉发育的调控.研究大鼠视皮质发育不同阶段视皮质中差异基因的表达对视觉发育的研究可提供理论依据. 目的 应用基因芯片技术研究SD(Sprague-Dawley)大鼠出生后不同时间点视皮质中差异基因表达谱的变化. 方法 60只清洁级雌性SD大鼠分为刚出生组(0d,20只)、睁眼前组(生后10d,15只)和视皮质发育关键期前组(生后20 d,15只)、视皮质发育完成后组(生后45 d,10只).所有大鼠在相对应的时间点处死并取出新鲜大脑视皮质,用基因芯片技术检测差异基因的表达,用实时定量PCR(RT-PCR)法验证基因芯片技术检测出的差异表达比率≥2.0的基因的mRNA表达水平.对相邻鼠龄12个基因进行了36组时间点配对,即每个基因3组配对,分别为P45/P0、P20/P0、P10/P0,用基因芯片技术和RT-PCR法分析大鼠视皮质差异基因表达与鼠龄的关联性.结果 在上述不同时间点,基因芯片技术检出的差异表达比率≥2.0倍的基因包括Akap7、Asam、Casp3、Cxcr4、Egr1、Ennp2、Fabp7、Gpr88、Inpp5d、Rpa、Stk32c和Vamp1共12个基因,real-time PCR验证结果表明,26个探针的24个基因(其中有2对探针代表相同的基因)具有相同的变化趋势,其中20个探针表现为正

作者:杨柳;瞿远珍;李岱;吴开力

来源:中华实验眼科杂志 2014 年 32卷 8期

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杨柳;瞿远珍;李岱;吴开力
来源:
中华实验眼科杂志 2014 年 32卷 8期
标签:
基因表达谱 大鼠 视皮质/生长和发育 寡核苷酸阵列序列分析 神经元可塑性 聚合酶链反应 Gene expression profiling Rat,Sprague-Dawley Visual cortex/growth and development Oligonucleotide array sequence analysis Neuronal plasticity Polymerase chain reaction
背景 哺乳动物视觉适应机制与其视皮质发育密切相关,在不同发育阶段的视皮质中,有不同生物学功能的多种基因参与视觉发育的调控.研究大鼠视皮质发育不同阶段视皮质中差异基因的表达对视觉发育的研究可提供理论依据. 目的 应用基因芯片技术研究SD(Sprague-Dawley)大鼠出生后不同时间点视皮质中差异基因表达谱的变化. 方法 60只清洁级雌性SD大鼠分为刚出生组(0d,20只)、睁眼前组(生后10d,15只)和视皮质发育关键期前组(生后20 d,15只)、视皮质发育完成后组(生后45 d,10只).所有大鼠在相对应的时间点处死并取出新鲜大脑视皮质,用基因芯片技术检测差异基因的表达,用实时定量PCR(RT-PCR)法验证基因芯片技术检测出的差异表达比率≥2.0的基因的mRNA表达水平.对相邻鼠龄12个基因进行了36组时间点配对,即每个基因3组配对,分别为P45/P0、P20/P0、P10/P0,用基因芯片技术和RT-PCR法分析大鼠视皮质差异基因表达与鼠龄的关联性.结果 在上述不同时间点,基因芯片技术检出的差异表达比率≥2.0倍的基因包括Akap7、Asam、Casp3、Cxcr4、Egr1、Ennp2、Fabp7、Gpr88、Inpp5d、Rpa、Stk32c和Vamp1共12个基因,real-time PCR验证结果表明,26个探针的24个基因(其中有2对探针代表相同的基因)具有相同的变化趋势,其中20个探针表现为正