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目的:通过网络药理学方法研究二甲双胍治疗糖尿病视网膜病变(DR)的分子药效机制。方法:自Pubchem数据库获取二甲双胍的化学结构,通过PharmMapper、SwissTargetPrediction及DrugBank数据库获取药物作用的靶点基因;通过GeneCards和DisGeNET获取数据库内DR的致病基因。取二甲双胍的作用靶点基因与DR致病基因的交集,将交集内的基因作为二甲双胍治疗DR的目标基因。通过STRING数据库构建目标基因的蛋白-蛋白互作网络。通过Metascape对目标基因进行生物本体论和功能通路分析。结果:获取了31个二甲双胍治疗DR的目标基因。这些基因的生物学过程主要富集于对缺氧的反应及核苷酸代谢等;细胞组件主要富集于微绒毛、细胞紧密连接等;分子功能主要富集于辅助因子结合、一氧化氮合成酶(NOS)活性等;功能通路富集于止血、血管内皮生长因子(VEGF)信号通路等。结论:二甲双胍主要通过影响细胞之间紧密连接、细胞缺氧反应、NOS以及VEGF信号通路等控制DR的进展。

作者:陈源;邢茜;黄正如

来源:中华实验眼科杂志 2020 年 38卷 12期

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作者:
陈源;邢茜;黄正如
来源:
中华实验眼科杂志 2020 年 38卷 12期
标签:
二甲双胍 糖尿病视网膜病变 药理学 基因 Metformin Diabetic retinopathy Pharmacology Gene
目的:通过网络药理学方法研究二甲双胍治疗糖尿病视网膜病变(DR)的分子药效机制。方法:自Pubchem数据库获取二甲双胍的化学结构,通过PharmMapper、SwissTargetPrediction及DrugBank数据库获取药物作用的靶点基因;通过GeneCards和DisGeNET获取数据库内DR的致病基因。取二甲双胍的作用靶点基因与DR致病基因的交集,将交集内的基因作为二甲双胍治疗DR的目标基因。通过STRING数据库构建目标基因的蛋白-蛋白互作网络。通过Metascape对目标基因进行生物本体论和功能通路分析。结果:获取了31个二甲双胍治疗DR的目标基因。这些基因的生物学过程主要富集于对缺氧的反应及核苷酸代谢等;细胞组件主要富集于微绒毛、细胞紧密连接等;分子功能主要富集于辅助因子结合、一氧化氮合成酶(NOS)活性等;功能通路富集于止血、血管内皮生长因子(VEGF)信号通路等。结论:二甲双胍主要通过影响细胞之间紧密连接、细胞缺氧反应、NOS以及VEGF信号通路等控制DR的进展。