目的 采用生物信息学方法分析预后相关的自噬相关基因在泛癌中的表达并构建肾透明细胞癌(KIRC)的预后模型以准确评估患者的预后.方法 于GEPIA数据库筛选与预后相关的自噬相关基因,得到的基因用ssGSEA计算其在各癌症中的自噬评分,以量化其在癌症中的表达.单因素、多因素Cox回归分析筛出自噬评分与KIRC患者预后的相关性.edgeR包分析KIRC患者差异表达的自噬基因,再进行逐步、LASSO和多因素Cox回归分析以构建风险预后模型,生存曲线、受试者工作特征曲线(ROC)评估模型的预测价值.CIBERSORT计算高低风险组间免疫细胞的浸润情况,采用CellMiner数据库筛选模型基因的敏感性药物.结果 与预后相关的自噬相关基因在各癌症中的表达存在差异,其中在KIRC中表达最高,且自噬评分与其预后密切相关.经逐步回归分析、LASSO分析筛选出4 个KIRC的预后模型基因,并经多因素Cox回归分析显示,BIRC5 和EIF4EBP1 高表达是影响KIRC预后的危险因素[HR(95
作者:伍艳婷;舒文莹;王艳平;周毅;简晓顺
来源:疑难病杂志 2023 年 22卷 8期