目的:探讨n7-甲基鸟苷(m7G)相关长链非编码RNA(lncRNA)的表达与胶质瘤预后的关系,并建立m7G相关lncRNA评估胶质瘤患者预后的模型。方法:从癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)数据库和中国胶质瘤基因组图谱(CGGA)数据库下载测试集和验证集相关数据。对数据进行LASSO回归分析和随机森林算法,建立与m7G相关lncRNA胶质瘤预后模型。利用提取后的12个lncRNA系数加权表达水平计算出个体化的风险评分,根据中位风险评分将测试集和验证集胶质瘤患者分为高风险组和低风险组。绘制Kaplan-Meier生存曲线,比较采用log-rank检验。绘制受试者工作特征(ROC)曲线,评估风险评分预测胶质瘤患者1、3和5年生存率的效能。结果:共获得12个与m7G相关的lncRNA,风险评分= 1.026 × AC002454.1 + 1.086 × AC131097.4 + 1.039 × AC147651.3 + 1.01 × AGAP2-AS1 + 1.036 × CRNDE + 0.733 × GDNF-AS1 + 1.321 × HOXD-AS2 + 0.934 × LINC00641 + 1.183 × PAXIP1-AS2 + 1.258 × PVT1 + 0.909 × SOX21-AS1 + 0.754 × TTC28-AS1,中位风险评分为- 0.45分。Kaplan-Meier生存曲线分析结果显示,高风险组中位生存时间明显短于低风险组(1.98年比9.51年,log-rank
χ2 = 131.78,
P<0.01)。ROC曲线分析结果显示
作者:冯鑫;张申;赵宇航;刘岳
来源:中国医师进修杂志 2023 年 46卷 7期