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目的 探讨胰腺癌相关糖尿病( PCA-DM)致病基因的表达谱,为PCA-DM发病机制的研究提供新线索. 方法 对前期获得的4例PCA-DM患者、4例无糖尿病胰腺癌( PC)患者和4例慢性胰腺炎( CP)患者胰腺组织基因芯片分析结果进一步进行盒图、火山图、热图分析;基因相互作用网络分析;染色体定位分析;Gene ontology ( GO)分析,并采用实时PCR对差异表达基因进行验证. 结果 芯片检测质量可靠. PCA-DM与无糖尿病PC差异表达基因共2778个,其中表达倍数差异>10的有123个基因;无糖尿病PC与CP差异表达基因共7475个,其中表达倍数差异>10的有730个. PCA-DM与无糖尿病PC差异表达基因的数量及差异倍数明显少于无糖尿病PC与CP的差异表达基因. PCA-DM和无糖尿病PC的差异表达基因大多分布于PC与CP差异表达基因的染色体位点上. GO分析显示,与药物代谢、色素沉着、GTPase活性有关的条目上调,而与蛋白代谢、核酸代谢有关的条目下调. 在PCA-DM相关基因网络中,HSPA1A、CSNK1A1、EIF4A2、MYCBP2、PRKRA、NGFR等40 个基因参与PCA-DM发生. TFF1、MSMB、NOX1等13个基因对PCA-DM具有潜在诊断价值. 结论 建立了PCA-DM致病基因表达谱,发现了潜在的致病基因及具有潜在诊断价值的基因.

作者:林青;李志花;郑上游;周泉波;谭浪平;李国林;宋亚东;赵晓慧;高文超

来源:中华胰腺病杂志 2015 年 15卷 5期

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作者:
林青;李志花;郑上游;周泉波;谭浪平;李国林;宋亚东;赵晓慧;高文超
来源:
中华胰腺病杂志 2015 年 15卷 5期
标签:
胰腺肿瘤 糖尿病 基因表达谱 芯片分析技术 Pancreatic neoplasms Diabetes mellitus Gene expression profiling Nicrochip analytical procedures
目的 探讨胰腺癌相关糖尿病( PCA-DM)致病基因的表达谱,为PCA-DM发病机制的研究提供新线索. 方法 对前期获得的4例PCA-DM患者、4例无糖尿病胰腺癌( PC)患者和4例慢性胰腺炎( CP)患者胰腺组织基因芯片分析结果进一步进行盒图、火山图、热图分析;基因相互作用网络分析;染色体定位分析;Gene ontology ( GO)分析,并采用实时PCR对差异表达基因进行验证. 结果 芯片检测质量可靠. PCA-DM与无糖尿病PC差异表达基因共2778个,其中表达倍数差异>10的有123个基因;无糖尿病PC与CP差异表达基因共7475个,其中表达倍数差异>10的有730个. PCA-DM与无糖尿病PC差异表达基因的数量及差异倍数明显少于无糖尿病PC与CP的差异表达基因. PCA-DM和无糖尿病PC的差异表达基因大多分布于PC与CP差异表达基因的染色体位点上. GO分析显示,与药物代谢、色素沉着、GTPase活性有关的条目上调,而与蛋白代谢、核酸代谢有关的条目下调. 在PCA-DM相关基因网络中,HSPA1A、CSNK1A1、EIF4A2、MYCBP2、PRKRA、NGFR等40 个基因参与PCA-DM发生. TFF1、MSMB、NOX1等13个基因对PCA-DM具有潜在诊断价值. 结论 建立了PCA-DM致病基因表达谱,发现了潜在的致病基因及具有潜在诊断价值的基因.