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目的 环状RNA(circRNA)在肿瘤发生发展中发挥重要作用,但其与鼻咽癌的关系鲜有报道.文中旨在检测circRNA在人鼻咽癌组织及慢性鼻咽黏膜炎组织的表达谱差异. 方法 应用高通量circRNA芯片技术,采集2016年11月至2017年3月在广东医科大学附属医院进行活检的鼻咽癌组织和鼻咽慢性黏膜炎组织标本各3份,分析circRNA表达谱差异.通过对原始数据进行预处理、归一化,筛选出差异表达的circRNA,并对其进行聚类分析,Gene Ontology (GO)分析及KEGG Pathway分析,分析差异circRNA的功能分类及相关通路. 结果 鼻咽癌组织与慢性鼻咽黏膜炎组织之间共筛选出差异表达circRNA 829个,其中鼻咽癌组织中表达上调者761个,下调者68个.差异表达circRNA主要与细胞周期、细胞增殖等生物学进程有关;主要参与p53信号通路,细胞周期信号通路和DNA复制信号通路等. 结论 差异表达的circRNA与鼻咽癌的发生发展密切相关.

作者:黄静;李欣晓;吴伟豪;阮晓文;潘璀璇;江丹贤;余忠华

来源:医学研究生学报 2018 年 31卷 8期

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作者:
黄静;李欣晓;吴伟豪;阮晓文;潘璀璇;江丹贤;余忠华
来源:
医学研究生学报 2018 年 31卷 8期
标签:
鼻咽癌 环状RNA 环状RNA芯片
目的 环状RNA(circRNA)在肿瘤发生发展中发挥重要作用,但其与鼻咽癌的关系鲜有报道.文中旨在检测circRNA在人鼻咽癌组织及慢性鼻咽黏膜炎组织的表达谱差异. 方法 应用高通量circRNA芯片技术,采集2016年11月至2017年3月在广东医科大学附属医院进行活检的鼻咽癌组织和鼻咽慢性黏膜炎组织标本各3份,分析circRNA表达谱差异.通过对原始数据进行预处理、归一化,筛选出差异表达的circRNA,并对其进行聚类分析,Gene Ontology (GO)分析及KEGG Pathway分析,分析差异circRNA的功能分类及相关通路. 结果 鼻咽癌组织与慢性鼻咽黏膜炎组织之间共筛选出差异表达circRNA 829个,其中鼻咽癌组织中表达上调者761个,下调者68个.差异表达circRNA主要与细胞周期、细胞增殖等生物学进程有关;主要参与p53信号通路,细胞周期信号通路和DNA复制信号通路等. 结论 差异表达的circRNA与鼻咽癌的发生发展密切相关.