目的 lncRNAs在不同种族肝细胞癌中的表达异同目前并不明确.文中旨在分析TCGA数据库中黄色人种、白色人种和黑色人种肝细胞癌共有和特有lncRNAs差异谱并预测其功能和调控机制. 方法 通过对黄色人种、白色人种和黑色人种的HCC患者的癌和癌旁组织进行差异分析得到各自的差异的lncRNAs,并比较3个人种差异lncRNAs基因谱情况,用韦恩图找出3个人种共有的差异lncRNAs.并对筛选出的差异lncRNAs进行生存分析、ceRNA网络构建和靶基因预测并对靶基因行GO、KEGG富集分析和转录因子预测,从而预测其调控机制. 结果 3个人种共有的肝细胞癌差异lncRNAs 49个,白色人种和黑色人种重叠基因21.5％,白色人种与黄色人种、黑色人种与黄色人种差异lncRNAs重叠率仅为7.8％和5.8％.3个人种共有的LINC01224可预测到靶基因,行GO富集分析显示,其功能和DNA复制、转位、基因表达调控、表观遗传、miRNAs基因沉默及RNA转录后基因沉默等有关;KEGG分析显示,LINC01224和细胞周期调控、DNA复制相关.白色人种生存相关的的11个lncRNAs基因中未预测到靶基因.黄色人种肝细胞癌生存相关的6个lncRNAs中,AC093609.1的靶基因通过GO富集后结果显示,其功能和离子通道活性如钙通道活性、被动跨膜转运蛋白活性有关;KEGG结果显示其参与心肌病、心肌细胞肾上
作者：马佳康；任凯凯；李雨濛；李南；张玲；王健；孙金旗；周博；马军
来源：医学研究生学报 2019 年 32卷 10期
