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目的 检测我国镇江地区2008年手足口病(HFMD)散发病例中的肠道病毒71型(EV71),并进行毒株的种系进化分析.方法 采集临床HFMD患者粪便标本,抽提病毒RNA,通过巢式聚合酶链反应技术进行特异性扩增.经琼脂糖凝胶电泳鉴定为阳性的标本,采用EV71特异性引物对其VP1区的核苷酸序列进行扩增.扩增的VP1片段经纯化后与测序载体PET32a(+)连接,转化大肠埃希菌DH5α,并对阳性质粒进行酶切和测序鉴定.利用Clustalx和MEGA4.0分析软件,进行系统进化分析.结果 通过聚合酶链反应扩增获得EV71 VP1基因,根据遗传进化分析发现该病毒株与1999、2000年在美国亚特兰大以及2000年中国北京地区流行的EV71型遗传距离较近,均属于C型.结论 镇江地区HFMD患者中分离的EV71病毒株属C基因型.

作者:吴燕;高晶晶;于苏兰;袁潇;王胜军

来源:医学综述 2009 年 15卷 24期

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作者:
吴燕;高晶晶;于苏兰;袁潇;王胜军
来源:
医学综述 2009 年 15卷 24期
标签:
手足口病 EV71 肠道病毒属 系统进化分析
目的 检测我国镇江地区2008年手足口病(HFMD)散发病例中的肠道病毒71型(EV71),并进行毒株的种系进化分析.方法 采集临床HFMD患者粪便标本,抽提病毒RNA,通过巢式聚合酶链反应技术进行特异性扩增.经琼脂糖凝胶电泳鉴定为阳性的标本,采用EV71特异性引物对其VP1区的核苷酸序列进行扩增.扩增的VP1片段经纯化后与测序载体PET32a(+)连接,转化大肠埃希菌DH5α,并对阳性质粒进行酶切和测序鉴定.利用Clustalx和MEGA4.0分析软件,进行系统进化分析.结果 通过聚合酶链反应扩增获得EV71 VP1基因,根据遗传进化分析发现该病毒株与1999、2000年在美国亚特兰大以及2000年中国北京地区流行的EV71型遗传距离较近,均属于C型.结论 镇江地区HFMD患者中分离的EV71病毒株属C基因型.