目的 构建与细胞焦亡相关的长链非编码RNA(lncRNA)的甲状腺癌预后模型,并探索其预测价值.方法 MSigDB数据库获得细胞焦亡相关的基因;癌症基因组图谱数据库中获取甲状腺癌患者的测序数据和临床资料并按1∶1的比例分为实验组和验证组;构建细胞焦亡相关基因和lncRNAs的共表达网络,并筛选相关系数|r|>0.5且P<0.001的lncRNAs.单因素Cox回归分析确定与预后相关lncRNAs.采用Lasso-Cox回归分析构建预后模型,计算实验组和验证组的风险评分.根据风险评分的受试者操作特征(ROC)曲线的最佳截断值将甲状腺癌患者分为高危组和低危组.利用Kaplan-Meier法进行生存分析.单因素和多因素Cox回归分析评估风险评分的独立预后价值.CIBERSORT分析肿瘤内的免疫浸润,分析风险评分与免疫检查点的相关性.结果 本研究共得到1 035个细胞焦亡相关的lncRNAs,最终筛选获得10个细胞焦亡相关lncRNAs.风险评分=1.197×AC092809.3+0.285× MIR3945HG+1.886×AL450326.1+1.457×AL360181.2+0.539×LMNTD2-AS1+1.090×AC069360.1-0.709×DOCK9-DT+0.841×GAPLINC+1.013×PARAL1+0.870 × SLC12A5-AS1,ROC曲线获取的最佳截断值为0.050.高危组患者生存率低于低危组患者(P<0.01).单因素及多因素Cox回归分析结果显示,风险评分的HR值分别为2.718(9
作者:许绍廷;张赟建
来源:中国医药导报 2023 年 20卷 15期