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目的 研究白桦硫氧还蛋白(Betula platyphylla thioredoxin,BpTRX)基因全长和启动子序列及其编码结构和性质,揭示其在硫化氢(H2S)处理下BpTRX的表达模式.方法 通过PCR手段克隆BpTRX基因,应用染色体步移技术获得BpTRX启动子区序列,并对BpTRX基因、启动子及其编码蛋白进行生物信息学分析,构建BpTRX系统进化树.利用实时荧光定量PCR定量分析BpTRX基因在H2S外源胁迫处理下的表达模式.结果 BpTRX基因全长351 bp,编码了由117个氨基酸组成的蛋白.BpTRX基因与蓖麻、大豆、苜蓿和葡萄TRX-H型蛋白亲缘关系紧密.获得的BpTRX启动子区序列为873bp,包含了转录必备的元件以及大量的胁迫响应和激素响应元件等.结论 获得BpTRX基因的全长和部分启动子序列,BpTRX基因对H2S处理的响应趋势为双峰形式,即先增加后降低、再增加再降低.

作者:王紫晴;黄雅婷;聂婷婷;范桂枝

来源:中草药 2018 年 49卷 2期

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作者:
王紫晴;黄雅婷;聂婷婷;范桂枝
来源:
中草药 2018 年 49卷 2期
标签:
白桦 硫氧还蛋白 硫化氢 生物信息学分析 实时荧光定量PCR Betula platyphylla Suk. thioredoxin hydrogen sulfide bioinformatic analysis quantitative real-time PCR
目的 研究白桦硫氧还蛋白(Betula platyphylla thioredoxin,BpTRX)基因全长和启动子序列及其编码结构和性质,揭示其在硫化氢(H2S)处理下BpTRX的表达模式.方法 通过PCR手段克隆BpTRX基因,应用染色体步移技术获得BpTRX启动子区序列,并对BpTRX基因、启动子及其编码蛋白进行生物信息学分析,构建BpTRX系统进化树.利用实时荧光定量PCR定量分析BpTRX基因在H2S外源胁迫处理下的表达模式.结果 BpTRX基因全长351 bp,编码了由117个氨基酸组成的蛋白.BpTRX基因与蓖麻、大豆、苜蓿和葡萄TRX-H型蛋白亲缘关系紧密.获得的BpTRX启动子区序列为873bp,包含了转录必备的元件以及大量的胁迫响应和激素响应元件等.结论 获得BpTRX基因的全长和部分启动子序列,BpTRX基因对H2S处理的响应趋势为双峰形式,即先增加后降低、再增加再降低.