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目的 通过网络药理学及分子对接技术预测金振口服液(Jinzhen Oral Liquid,JOL)干预新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制.方法 通过文献挖掘以及DisGeNET、OMIM、KEGG、UniProt数据库联用检索与COVID-19相关的蛋白靶点.借助Traditional Chinese Medicine Network (TCMN)信息平台检索JOL中的化合物,运用Cytoscape 3.2.1构建药材-化合物-靶点网络来预测JOL治疗COVID-19的活性成分及作用靶点.在RCSB PDB数据库中检索获取新型冠状病毒(SARS-CoV-2) 3CL水解酶(3CLpro)和血管紧张素转化酶Ⅱ (ACE2)的晶体结构,借助AutoDock Vina软件将活性化合物与2个蛋白进行分子对接.结果 药材-化合物-靶点网络包含异甘草酸内酯、贝母辛、番泻苷B等75个化合物分别来自甘草、大黄和平贝母3味药材,哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)、Janus激酶3(JAK3)、丝裂原活化蛋白激酶激酶1 (MEK1)等28个靶点.网络特征分析阐明了JOL治疗COVID-19的9个关键化合物(异甘草酸内酯、甘草内酯、去氢鄂贝定碱、desoxo-glabrolid-acetate、贝母辛、贝母素乙、乌苏里啶酮、西贝素和euchrenone A5)以及10个潜在作用靶(mTOR、JAK3、ACE2、TNFA、AKT2、PIK3CA、MEK1、BRD2、ACE、ANPEP).分子对接显示,JOL中部分活性化合物对3CLpro和ACE2蛋白具有一定的亲和

作者:陶晓倩;柯志鹏;张新庄;邓奕;曹泽彧;曹亮;王振中;肖伟

来源:中草药 2020 年 51卷 9期

知识库介绍

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陶晓倩;柯志鹏;张新庄;邓奕;曹泽彧;曹亮;王振中;肖伟
来源:
中草药 2020 年 51卷 9期
标签:
金振口服液 新型冠状病毒 新型冠状病毒肺炎 网络药理学 分子对接技术 细胞因子风暴
目的 通过网络药理学及分子对接技术预测金振口服液(Jinzhen Oral Liquid,JOL)干预新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制.方法 通过文献挖掘以及DisGeNET、OMIM、KEGG、UniProt数据库联用检索与COVID-19相关的蛋白靶点.借助Traditional Chinese Medicine Network (TCMN)信息平台检索JOL中的化合物,运用Cytoscape 3.2.1构建药材-化合物-靶点网络来预测JOL治疗COVID-19的活性成分及作用靶点.在RCSB PDB数据库中检索获取新型冠状病毒(SARS-CoV-2) 3CL水解酶(3CLpro)和血管紧张素转化酶Ⅱ (ACE2)的晶体结构,借助AutoDock Vina软件将活性化合物与2个蛋白进行分子对接.结果 药材-化合物-靶点网络包含异甘草酸内酯、贝母辛、番泻苷B等75个化合物分别来自甘草、大黄和平贝母3味药材,哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)、Janus激酶3(JAK3)、丝裂原活化蛋白激酶激酶1 (MEK1)等28个靶点.网络特征分析阐明了JOL治疗COVID-19的9个关键化合物(异甘草酸内酯、甘草内酯、去氢鄂贝定碱、desoxo-glabrolid-acetate、贝母辛、贝母素乙、乌苏里啶酮、西贝素和euchrenone A5)以及10个潜在作用靶(mTOR、JAK3、ACE2、TNFA、AKT2、PIK3CA、MEK1、BRD2、ACE、ANPEP).分子对接显示,JOL中部分活性化合物对3CLpro和ACE2蛋白具有一定的亲和