目的 为了探知宁夏枸杞Lycium barbarum花药发育过程及挖掘花药发育相关基因.方法 以单双核花粉时期和成熟花粉时期的花药为研究材料,通过高通量Illumina HiSeq2500测序平台进行转录组分析.结果 组装共获得128151条Unigene,将Unigene与NCBI的非冗余蛋白质数据库(non-redundant protein databasse,NR)、去冗余的蛋白序列数据库(Swiss prot protein database,Swiss-Prot)、基因本体数据库(gene ontology,GO)、直源同源群集数据库(clusters of orthologous groups,COG)、真核同源群数据库(euKaryotic orthologous groups,KOG)、基因功能和代谢途径数据库(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)数据库比对,共有40140条得到注释.在错误发现率(false discovery rate,FDR) <0.05且差异倍数(fold change,FC)≥2的条件下,单双核花粉时期与成熟花粉时期的差异表达基因共有46个.KEGG注释发现有4个差异表达基因参与甘油酯代谢、亚油酸代谢、苯丙氨酸代谢和苯丙烷类生物合成4个途径中.富含亮氨酸重复蛋白、细胞周期蛋白、类受体蛋白激酶、E3泛素蛋白连接酶等11个差异表达基因参与了花药发育过程.随机选取其中5个差异表达基因进行qRT-PCR验证,表达结果与转录组数据基本一致,表明其数据真实可靠.结论 为进一步
作者:范文强;刘雪霞;马小兰;王路瑶;张兴;岳思君;唐建宁;朱金忠;姚新灵;郑蕊
来源:中草药 2022 年 53卷 3期