目的 对不同干旱胁迫程度下党参Codonopsis pilosula叶、茎、根进行转录组测序,探究干旱胁迫对党参差异基因和多糖合成相关酶基因的调控.方法 利用IlluminaHiSeq2500高通量测序技术对正常水分(85%~90%)和轻度(65%~70%)、中度(50%~55%)、重度干旱胁迫(35%~40%)下生长旺盛期党参叶、茎、根组织进行测序并建立cDNA数据库,经de novo拼接后得到Unigene,并进一步开展生物信息学分析.结果 共获得Unigene 60 377条,分别有51 477、29 896、33 479、35 912、47 378、18 649、31 833 条被非冗余数据库(non-redundant protein sequence database,NR)、真核生物蛋白相邻类的聚簇(clusters of orthologous group for eukaryotic complete,KOG)、基因本体(gene ontology,GO)、Swiss-Prot、eggNOG、京都基因与基因组数据库(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)、Pfam等数据库注释,筛选到9个差异组DEGs总和89 369条,GO富集分析发现,党参叶、茎、根中的DEGs在GO功能注释中分布基本一致,主要集中于细胞、细胞部分、细胞过程、代谢过程、结合蛋白、催化活性等功能.KEGG途径富集结果表明,干旱胁迫下叶中DEGs显著富集在不饱和脂肪酸、苯丙烷生物合成,茎中DEGs主要富集在苯丙烷、角质、琥珀和蜡、淀粉和
作者:孙晓琛;栗锦鹏;原静静;王惠珍
来源:中草药 2022 年 53卷 14期