目的:应用逆转录多聚酶链式反应(RT-PCR)分析CD44在鼻咽癌组织和鼻咽癌细胞株中表达,来寻找新的人CD44剪接变异体.方法:在CD44基因起始和终止密码子两端及变异剪接外显子v10中和剪接位点处设计特异性引物,以鼻咽癌组织、细胞株5-8F和HNEl eDNA为模板进行RT-PeR扩增,产物测序.然后,应用生物信息学对克隆序列进行分析.结果:新克隆的CD44剪接变异体有1634bp,包含一个完整的阅读框,起始密码子在序列的12位,终止密码子在序列的1301位,可变剪接区只有变异型剪接外显子10,预测编码429氨基酸.GenBank登陆号:EF581837.结论:一个新的、预测编码429个氨基酸的CD44剪接变异体存在于研究的人鼻咽癌组织和细胞株中,它的功能有待于进一步研究.
作者：向秋；何晓松；朱华；雷迅；凌月福；肖胜军；范才文；黄岚珍；王建红
来源：中国病理生理杂志 2008 年 24卷 9期
