目的 利用GEO基因芯片结合网络药理学和分子对接技术探究玉屏风散(YPFP)治疗原发性肾病综合征(primary nephrotic syndrome,PNS)的作用机制.方法 利用TCMSP数据库、文献挖掘以及靶点预测工具Swiss Target Prediction数据库筛选YPFS活性成分及其对应的作用靶点,通过GeneCards、OMIM、Drugbank数据库检索PNS靶点,再结合GEO基因芯片,汇总得到PNS疾病靶点,将所得活性成分作用靶点与疾病靶点取交集,借助可视化软件Cytoscape 3.9.1 软件构建"YPFP-药物成分-交集靶点"网络,应用STRING数据库进行蛋白互作分析,获取核心靶点,利用Metascape数据库对核心靶点进行GO基因功能以及KEGG信号通路富集分析.应用AutoDock Tools-1.5.6 软件进行分子对接分析.结果 得到YPFP活性成分 56 个,与PNS的交集靶点 136 个,拓扑分析提示YPFP治疗PNS的核心成分为槲皮素、山奈酚、汉黄芩素、升麻素、β-谷甾醇等.获取核心靶点 40 个,TP53、SRC、JUN、RELA、AKT1 等可能是关键靶点.GO富集分析得到 1 192 个生物过程,66 个分子功能,44 个细胞组分.KEGG通路富集分析得到糖尿病并发症AGE-RAGE信号通路、HIF-1 信号通路、TGF-β信号通路、Wnt信号通路等 165 条相关信号通路.分子对接结果显示YPFP的核心成分与关键靶点具有较好的结合活性.结论
作者:徐奥;周慧玲;沈铁柱;李景;曾钰钰;金牮
来源:中国处方药 2023 年 21卷 10期