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目的 探究上皮细胞-间质细胞转化(EMT)对甲状腺癌发生的潜在机制,了解EMT相关基因在甲状腺癌组织表达情况并探讨其预后指导价值.方法 从TCGA数据库下载568份甲状腺癌转录组表达谱数据及508例患者临床资料,寻找转录组表达谱差异基因,并对差异基因进行功能富集分析.Western blot分别检测华北理工大学附属医院5例患者手术切除的甲状腺癌组织和相应癌旁组织纤维连接蛋白1(FN1)表达情况,以验证FN1差异表达;并检测上皮标志物E-cadherin表达水平,以了解甲状腺癌组织EMT水平.分析EMT相关基因FN1、MMP11和GLT8D2与差异基因相关性,并利用EMT相关基因构建Cox回归模型,预测Ⅰ~ⅣC期甲状腺癌患者的预后.结果 差异基因分析结果显示共1 136个基因在肿瘤和正常组织中差异表达,这些基因11.6%富集于EMT通路;Western blot检测FN1和E-cadherin结果显示,在甲状腺癌组织中FN1高表达,E-cadherin低表达;相关性分析结果显示,FN1、MMP11和GLT8D2与1 136个差异基因有较高相关性,尤其是FN1与484个基因皮尔森相关系数绝对值>0.5,最强正相关系数为0.853,最强负相关系数为-0.819;Cox回归分析结果显示,FN1、MMP11和GLT8D2联合对Ⅰ~ⅣC期患者预后有较高预测价值(AUC=0.893).结论 甲状腺癌组织存在EMT,FN1基因可能是甲状腺癌机制研究的

作者:杨春伟;王晓涛;赵永魁;杨光华;刘春辉;曹文斌;魏韬;张国志

来源:中国临床研究 2020 年 33卷 5期

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作者:
杨春伟;王晓涛;赵永魁;杨光华;刘春辉;曹文斌;魏韬;张国志
来源:
中国临床研究 2020 年 33卷 5期
标签:
上皮细胞-间质细胞转化 甲状腺癌 纤维连接蛋白1基因 癌症基因组图谱数据库 预后
目的 探究上皮细胞-间质细胞转化(EMT)对甲状腺癌发生的潜在机制,了解EMT相关基因在甲状腺癌组织表达情况并探讨其预后指导价值.方法 从TCGA数据库下载568份甲状腺癌转录组表达谱数据及508例患者临床资料,寻找转录组表达谱差异基因,并对差异基因进行功能富集分析.Western blot分别检测华北理工大学附属医院5例患者手术切除的甲状腺癌组织和相应癌旁组织纤维连接蛋白1(FN1)表达情况,以验证FN1差异表达;并检测上皮标志物E-cadherin表达水平,以了解甲状腺癌组织EMT水平.分析EMT相关基因FN1、MMP11和GLT8D2与差异基因相关性,并利用EMT相关基因构建Cox回归模型,预测Ⅰ~ⅣC期甲状腺癌患者的预后.结果 差异基因分析结果显示共1 136个基因在肿瘤和正常组织中差异表达,这些基因11.6%富集于EMT通路;Western blot检测FN1和E-cadherin结果显示,在甲状腺癌组织中FN1高表达,E-cadherin低表达;相关性分析结果显示,FN1、MMP11和GLT8D2与1 136个差异基因有较高相关性,尤其是FN1与484个基因皮尔森相关系数绝对值>0.5,最强正相关系数为0.853,最强负相关系数为-0.819;Cox回归分析结果显示,FN1、MMP11和GLT8D2联合对Ⅰ~ⅣC期患者预后有较高预测价值(AUC=0.893).结论 甲状腺癌组织存在EMT,FN1基因可能是甲状腺癌机制研究的