背景与目的 肺腺癌是危害人类健康最主要的肺癌类型之一,其发生机制仍不清楚.本研究利用生物信息学方法,筛选新的肺腺癌候选基因,为揭爪肺腺癌发病机制提供依据.方法 从GEO数据库中获得GSE10072和GSE7670两个数据集,然后利用dchip软件进行差异表达基因分析,将其获得的差异基囚定义为"榆测基因集"(testgene set);采用genecard和Fable文献挖掘已知肺腺癌疾病基因,并将其定义为.训练基凶集"(traingene set);最后,利用Toppgene筛选肺腺癌候选基因,并通过荧光定量PCR对其获得的部分基因进行验证.结果 获得一个含344个基因的"检测基冈集"和含277个基因的"训练基凼集".采用Toppgene共获得36个候选疾病基因,其中21个基因则在肿瘤方面的研究几无报道.荧光定量PCR实验研究发现,CD36、PMAIP1及FABP4三个基因在A549细胞中均为下调表达,与芯片数据一致.结论 Toppgenenf发现新的肺腺癌候选疾病基因,为下一步发现特异性肺腺癌致病基凶提供理论依据.
作者：王桂平；叶云；郑文岭；马文丽
来源：中国肺癌杂志 2010 年 13卷 4期
