背景与目的 SWI/SNF复合体(switch/sucrose nonfermentable chromatin-remodeling complex,SWI/SNF)是一种重要的染色质重塑复合物,其亚基变异在多种肿瘤中存在,并与多种肿瘤细胞生物学特征相关.但其基因突变是否参与非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)肝转移过程尚不清楚.本研究拟探究SWI/SNF复合体基因突变对NSCLC肝转移的影响及潜在机制.方法 我们使用全外显子组测序(whole-exome sequencing,WES)分析了NSCLC细胞H1299、H23和H460中SWI/SNF复合体基因突变.通过CRISPR/Cas9(clustered regularly interspaced short palindromic repeats)技术构建了ARID1A基因稳定敲除的H1299细胞株,建立了小鼠模型模拟NSCLC肝转移,观察不同基因突变对肝转移的影响.利用RNA-Seq和蛋白印迹分析差异基因的表达,并通过免疫组化技术(immunohistochemistry,IHC)检测了SWI/SNF复合体调控的靶分子在小鼠肝转移灶中的表达.结果 WES分析确定了SWI/SNF复合体基因的突变情况.动物实验结果显示SWI/SNF复合体基因突变与免疫缺陷小鼠较高的肝转移率相关.转录组测序和蛋白印迹分析显示SWI/SNF复合体基因突变细胞中ALDH1A1和APOBEC3B表达上调,尤其是ARID1A蛋白缺失的H460和H1299 sgARID1A中ALDH1A1表达水平显著上升.IHC染色
作者:高玲玲;谢至;林首恒;吕志异;周文斌;陈冀;朱琳琳;张莉;曾鹏辉;黄晓丹;颜文青;陈宇;卢丹霞;张水莲;郭伟浜;李鹏;张绪超
来源:中国肺癌杂志 2023 年 26卷 10期