目的 利用高通量测序技术与生物信息学分析,研究肺结核患者与健康个体肠道菌群构成与表型差异.方法 应用PE150(pair-end 2×150bp)测序方案对2020年4月14日至12月28日南华大学附属长沙中心医院收治的29例初治菌阳肺结核患者(肺结核组)与28名健康体检志愿者(对照组)的新鲜粪便样本菌群16S rRNA gene V4区进行测序,比对Silva数据库(Silva 128)对操作分类单位(operational taxonomic units,OTU)进行注释.QIIME软件计算OTU水平α多样性指数、β多样性指数,及门、属水平的相对丰度,并生成OTU水平丰度等级曲线(ranked abundance).R软件包"VennDiagram"生成韦恩图.R语言ggplot绘制属水平气泡图.BugBase软件对肠道菌群7类表型进行分类比较.结果 肺结核组与对照组比较肠道菌群α多样性指数中香农指数(Shannon index)分别为4.24±1.71 和5.64±0.85,差异有统计学意义(t=3.889,P＜0.01);辛普森指数(Simpson index)分别为[0.89(0.80,0.94)]和[0.94(0.90,0.96)],差异有统计学意义(Z=-3.256,P＜0.01);Chao1 指数分别为1085.35±659.99和 1844.04±658.95,差异有统计学意义(t=4.378,P＜0.01);ACE 指数分别为 1091.64±666.93和1857.34±657.90,差异有统计学意义(t=4.403,P＜0.01);β多样性构成差异有统计学意义(R2=0.253

作者：易一行；喻容；石国民；马小华；肖四方；税剑；范任华；向延根

来源：中国防痨杂志 2021 年 43卷 9期