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目的 建立熔解曲线分析法进行HPA-2基因分型,并检测大连地区汉族人群HPA-2等位基因频率.方法 实时荧光PCR后用熔解曲线分析法进行HPA-2基因分型,与常规PCR-SSP方法进行比较,用熔解曲线分析法对辽宁地区155名汉族血小板捐献者的HPA-2系统进行基因分型,获得HPA-2等位基因分布数据,并与国内部分地区的人群进行比较.结果 基因型为HPA-2aa的样本,熔解曲线呈现单一的峰型,Tm值在(85±1)℃;基因型为HPA-2ab的样本熔解曲线呈现双峰型,Tm值在(80±1)℃和(85±1)℃;基因型为HPA-2bb的样本熔解曲线呈现单一的峰型,Tm值在(80±1)℃.熔解曲线分析法基因分型结果与PCR-SSP法完全一致.大连地区汉族人群HPA-2 a、HPA-2b等位基因频率分别为0.9161,0.0838.与南京、上海、新疆地区汉族人群以及新疆地区维吾尔族人群均很相似(P>0.05),但与海南黎族人群相比差异有统计学意义(P<0.05).结论 应用熔解曲线分析法进行HPA-2基因分型具有简单、快速、准确等优点,优于常规的PCR-SSP方法;HPA-2等位基因频率分布在国内存在种族差异.

作者:陈渝宁;王延伟

来源:中国公共卫生 2013 年 29卷 9期

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作者:
陈渝宁;王延伟
来源:
中国公共卫生 2013 年 29卷 9期
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熔解曲线分析法 血小板特异性抗原HPA-2 基因分型 melting curve analysis platelet antigen HPA-2 genotyping
目的 建立熔解曲线分析法进行HPA-2基因分型,并检测大连地区汉族人群HPA-2等位基因频率.方法 实时荧光PCR后用熔解曲线分析法进行HPA-2基因分型,与常规PCR-SSP方法进行比较,用熔解曲线分析法对辽宁地区155名汉族血小板捐献者的HPA-2系统进行基因分型,获得HPA-2等位基因分布数据,并与国内部分地区的人群进行比较.结果 基因型为HPA-2aa的样本,熔解曲线呈现单一的峰型,Tm值在(85±1)℃;基因型为HPA-2ab的样本熔解曲线呈现双峰型,Tm值在(80±1)℃和(85±1)℃;基因型为HPA-2bb的样本熔解曲线呈现单一的峰型,Tm值在(80±1)℃.熔解曲线分析法基因分型结果与PCR-SSP法完全一致.大连地区汉族人群HPA-2 a、HPA-2b等位基因频率分别为0.9161,0.0838.与南京、上海、新疆地区汉族人群以及新疆地区维吾尔族人群均很相似(P>0.05),但与海南黎族人群相比差异有统计学意义(P<0.05).结论 应用熔解曲线分析法进行HPA-2基因分型具有简单、快速、准确等优点,优于常规的PCR-SSP方法;HPA-2等位基因频率分布在国内存在种族差异.