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目的 了解辽宁省锦州市啮齿动物中鼠种构成、带毒率、汉坦病毒(HV)流行情况及病毒分型.方法 采用间接免疫荧光法(IFA)检测鼠肺中HV抗原;用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)法扩增阳性样品中的部分M片段;构建系统发生树进行系统发生分析及分型.结果 2008-2013年锦州市出血热疫区捕鼠1 838只,分属2科4属5种,病毒携带率为4.24% (78/1 838);各年之间鼠肺带毒率有统计学意义(x2=13.579,P =0.019,P <0.05);部分M片段序列分析表明,1 1株病毒与汉城病毒(SEOV)核苷酸序列同源性为96.2%~100%,而与汉滩型病毒(HTNV)同源性仅为70.6% ~71.2%,系统进化树显示检测阳性的11株SEO起源相同,与BjHD01株病毒的亲缘关系最近.结论 锦州地区HV优势毒株为SEO型,变异较小,基因型别较为稳定,并有明显的地区聚集性.

作者:张旭;马鸣潇;张振;田晶;孙佩龙;周大宇;白梅;张浩纯;钟义

来源:中国公共卫生 2015 年 31卷 1期

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作者:
张旭;马鸣潇;张振;田晶;孙佩龙;周大宇;白梅;张浩纯;钟义
来源:
中国公共卫生 2015 年 31卷 1期
标签:
汉坦病毒(HV) 出血热 带毒率 系统发生分析 基因分型 hantavirus hemorrhagic fever virus infection rate phylogenetic analysis genotype
目的 了解辽宁省锦州市啮齿动物中鼠种构成、带毒率、汉坦病毒(HV)流行情况及病毒分型.方法 采用间接免疫荧光法(IFA)检测鼠肺中HV抗原;用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)法扩增阳性样品中的部分M片段;构建系统发生树进行系统发生分析及分型.结果 2008-2013年锦州市出血热疫区捕鼠1 838只,分属2科4属5种,病毒携带率为4.24% (78/1 838);各年之间鼠肺带毒率有统计学意义(x2=13.579,P =0.019,P <0.05);部分M片段序列分析表明,1 1株病毒与汉城病毒(SEOV)核苷酸序列同源性为96.2%~100%,而与汉滩型病毒(HTNV)同源性仅为70.6% ~71.2%,系统进化树显示检测阳性的11株SEO起源相同,与BjHD01株病毒的亲缘关系最近.结论 锦州地区HV优势毒株为SEO型,变异较小,基因型别较为稳定,并有明显的地区聚集性.