目的 分析贵州省贵阳市2013-2015年手足口病患儿肠道病毒71型(EV71) VP1和VP4基因特征,为手足口病疫苗的选用和临床诊治提供参考依据.方法 采集2013年8月-2015年4月在贵阳市第五人民医院就诊的120例手足口病轻症患儿鼻咽拭子和(或)粪便标本进行EV71病毒VP1和VP4全序列的逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增和测序,并与美国国立生物技术信息中心公布的EV71 A、B、C基因型代表株进行系统进化分析,根据进化分析结果对此2个片段随机抽取20例与其他地区相同基因型进行氨基酸位点变异分析.结果 所有样本病毒株均为C4基因亚型,与2008年北京、上海、安徽以及2011年深圳分离株成簇,20例EV71病毒株在VP1和VP4氨基酸位点变异与以上城市流行毒株相比,其中12例样本EV7的VP1片段氨基酸序列293位丙氨酸(A)变异为丝氨酸(S),其余位点均只有1例样本发生A26T、N31D、N282S突变,而VP4片段只有1个样本发生K52R突变.结论 贵阳市2013-2015年手足口病患儿的EV71流行株均属C基因型的C4亚型,VP1片段常见A293S、A26T、N31D和N282S突变,VP4片段偶有K52R突变.
作者:张正君;杨兴林;黄海
来源:中国公共卫生 2016 年 32卷 6期