目的 从全基因组关联研究(GWAS)发现的与2型糖尿病(T2DM)发病风险相关的单核苷酸基因多态性(SNP)位点中,筛选出可用于预测妊娠期糖尿病(GDM)女性产后出现T2DM的SNP.方法 利用2009—2010年天津市妊娠期糖尿病随机干预试验研究基线收集的1 240名GDM女性(80名T2DM和1 160名非T2DM)血样,检测并分析40个GWAS发现的与T2DM发病相关的SNP位点.基于单个SNP的遗传风险解释比例,结合产后T2DM的发生情况,联合采用ROC曲线下面积(AUC)、整合区分指数(IDI)及再分类净优化指数(NRI)进行候选SNP筛选.结果 以遗传风险解释比例最大的SNP(rs10906115)为基础,依次纳入其他的SNP,共发现1个SNP可显著改善AUC(P=0.019),8个SNP可显著改善IDI(P<0.05),8个SNP可显著改善NRI(P<0.05).综合所有40个GWAS发现的SNP位点对AUC、IDI及NRI的改善情况,共有11个SNP(rs10906115,rs2779116,rs7034200,rs7041847,rs780094,rs5015480,rs11212617,rs831571,rs7944584,rs6815464,rs35767)可用于预测GDM女性产后发生T2DM的风险,同时11个SNP可累计解释5.5%的GDM女性产后发生T2DM的遗传风险.结论 为避免资源浪费,建议在众多GWAS发现的与T2DM发病相关的SNP位点中,选择能够显著改善风险预测能力或风险再分类能力的11个SNP用于预测GDM女性产后发生T2DM的
作者:李卫芹;黄育北;刘慧坤;张爽;王蕾棽;李楠;李薇;胡刚;冷俊宏
来源:中国公共卫生 2019 年 35卷 6期