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目的 运用网络药理学分析方法进行仙灵骨葆治疗骨质疏松症(osteoporosis,OP)的药理机制分析.方法 借助中药系统药理学数据库和分析平台以及中药综合数据库获取仙灵骨葆活性成分以及相关靶标,运用Cytoscape 3.7.1软件绘制“活性成分-靶标”网络图,以“osteoporosis”为关键词从GeneCards:The Human Gene Database获取OP相关基因,运用STRING数据分析平台进行PPI(protein-protein interaction)网络分析,运用DAVID数据分析平台进行基因本体(gene ontology,GO)生物过程富集以及京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,并运用Cytoscape 3.7.1软件绘制“通路-靶标”网络图.结果 共获取仙灵骨葆相关活性成分115种,核心活性成分有槲皮素、山奈酚、木犀草素、淫羊藿苷元、丹参酮ⅡA等.活性成分所涉及的靶标共有301个,核心靶标有PTGS2、PTGS1、ESR1等.PPI网络显示了111种核心蛋白之间的互作关系,主要与调节细胞周期有关.GO富集生物过程经筛选后共获得46项,所得生物过程亦与细胞周期有关,正调控NF-kappaB转录活性因子的过程是OP发生的机制之一,与现有研究符合.KEGG通路富集共获得37项,提示仙灵骨葆治疗OP作用集中于PI3K-Akt、TNF、MAPK、Estrogen等信号通路.结论 仙灵

作者:綦向军;陈国铭;史佩玉;张兆萍;方彩珊;郑深建;邢万里;黎健敏;周润吉;徐福平

来源:中国骨质疏松杂志 2020 年 26卷 5期

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作者:
綦向军;陈国铭;史佩玉;张兆萍;方彩珊;郑深建;邢万里;黎健敏;周润吉;徐福平
来源:
中国骨质疏松杂志 2020 年 26卷 5期
标签:
骨质疏松症 仙灵骨葆 网络药理学 基因本体 通路富集 蛋白质-蛋白质相互作用
目的 运用网络药理学分析方法进行仙灵骨葆治疗骨质疏松症(osteoporosis,OP)的药理机制分析.方法 借助中药系统药理学数据库和分析平台以及中药综合数据库获取仙灵骨葆活性成分以及相关靶标,运用Cytoscape 3.7.1软件绘制“活性成分-靶标”网络图,以“osteoporosis”为关键词从GeneCards:The Human Gene Database获取OP相关基因,运用STRING数据分析平台进行PPI(protein-protein interaction)网络分析,运用DAVID数据分析平台进行基因本体(gene ontology,GO)生物过程富集以及京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,并运用Cytoscape 3.7.1软件绘制“通路-靶标”网络图.结果 共获取仙灵骨葆相关活性成分115种,核心活性成分有槲皮素、山奈酚、木犀草素、淫羊藿苷元、丹参酮ⅡA等.活性成分所涉及的靶标共有301个,核心靶标有PTGS2、PTGS1、ESR1等.PPI网络显示了111种核心蛋白之间的互作关系,主要与调节细胞周期有关.GO富集生物过程经筛选后共获得46项,所得生物过程亦与细胞周期有关,正调控NF-kappaB转录活性因子的过程是OP发生的机制之一,与现有研究符合.KEGG通路富集共获得37项,提示仙灵骨葆治疗OP作用集中于PI3K-Akt、TNF、MAPK、Estrogen等信号通路.结论 仙灵