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目的 对细粒棘球蚴病(cystic echinococcosis,CE)患者外周血微小RNA (microRNA,miRNA)进行差异性表达分析,并筛选新型潜在诊断标志物. 方法 提取3例临床确诊的CE患者血清和3名健康者血清miRNA,采用芯片Affymetrix miRNA4.0对血清中miRNA进行高通量筛选,通过生物信息学分析,找出差异性的miRNA.采用实时荧光定量PCR (qRT-PCR)对21例CE患者血清与25名健康者血清的差异miRNA进行验证分析.采用Pearson's相关性分析法分析miRNA与包囊重量或子囊个数的相关性.采用IBM SPSS 19.0软件分析不同miRNA的受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)与曲线下面积(area under curve,AUC). 结果 芯片对比分析结果显示,与健康者血清比较,CE患者血清中有172个miRNA上调2倍以上,35个下调1/2以下.qRT-PCR结果表明,hsa-miR-762、hsa-miR-3536、hsa-miR-6125、hsa-miR-6821-5P、hsa-miR-663a、hsa-miR-24-3P、hsa-miR-191-5P、hsa-miR-320a等8个上调miRNA的表达水平分别为10.28±0.38、5.11±0.34、11.02±0.55、11.87±0.58、5.31±0.36、5.75±0.51、5.75±0.51、4.96±0.36,均高于其对应的健康组(P<0.05).ROC曲线分析结果表明,8个miRNA的AUC均大于0.8,提示这些分子具有潜在的临床诊断价值.相关性分析

作者:任梦迪;宁玉烨;黎明;王浩;赵巍

来源:中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2017 年 35卷 5期

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作者:
任梦迪;宁玉烨;黎明;王浩;赵巍
来源:
中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2017 年 35卷 5期
标签:
细粒棘球蚴病 miRNA 生物标志物 miR-24-3p Cystic echinococcosis miRNA Biomarker MiR-24-3p
目的 对细粒棘球蚴病(cystic echinococcosis,CE)患者外周血微小RNA (microRNA,miRNA)进行差异性表达分析,并筛选新型潜在诊断标志物. 方法 提取3例临床确诊的CE患者血清和3名健康者血清miRNA,采用芯片Affymetrix miRNA4.0对血清中miRNA进行高通量筛选,通过生物信息学分析,找出差异性的miRNA.采用实时荧光定量PCR (qRT-PCR)对21例CE患者血清与25名健康者血清的差异miRNA进行验证分析.采用Pearson's相关性分析法分析miRNA与包囊重量或子囊个数的相关性.采用IBM SPSS 19.0软件分析不同miRNA的受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)与曲线下面积(area under curve,AUC). 结果 芯片对比分析结果显示,与健康者血清比较,CE患者血清中有172个miRNA上调2倍以上,35个下调1/2以下.qRT-PCR结果表明,hsa-miR-762、hsa-miR-3536、hsa-miR-6125、hsa-miR-6821-5P、hsa-miR-663a、hsa-miR-24-3P、hsa-miR-191-5P、hsa-miR-320a等8个上调miRNA的表达水平分别为10.28±0.38、5.11±0.34、11.02±0.55、11.87±0.58、5.31±0.36、5.75±0.51、5.75±0.51、4.96±0.36,均高于其对应的健康组(P<0.05).ROC曲线分析结果表明,8个miRNA的AUC均大于0.8,提示这些分子具有潜在的临床诊断价值.相关性分析