目的 利用生物信息学方法分析刚地弓形虫(Toxoplasma gondii)棒状体蛋白16 Ⅲ(ROP16Ⅲ)重组表达载体转染人肺腺癌A549细胞后的基因表达谱,筛选致病候选基因.方法 构建真核表达载体pEGFP-N1-ROP16Ⅲ.将A549细胞分为未转染组、pEGFP-N1组、pEGFP-N1-ROP16 Ⅲ组,后两组分别用pEGFP-N1、pEGFP-N1-ROP16Ⅲ质粒进行瞬时转染,48 h后收集各组细胞,提取总RNA,纯化后进行芯片杂交分析,筛选差异表达基因(DEG).将DEG进行基因本体(GO)功能富集分类和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析.利用ToppGene从DEG中筛选弓形虫ROP16Ⅲ致病候选基因.利用STRING在线分析软件对候选基因所编码的蛋白质进行蛋白间相互作用(PPI)网络分析.结果 pEGFP-N1-ROP16Ⅲ转染A549细胞后共有566个基因表达差异显著,其中382个基因上调,184个基因下调.对DEG进行生物信息学分析,共获得997条GO注释和50条KEGG信号通路.这些DEG参与了多种生物学过程,包括防御反应、Ⅰ型干扰素信号通路、先天免疫应答、对外界生物刺激的反应等;参与的信号通路主要集中在抗原处理及呈递,细胞质DNA传感通路,Toll样受体信号通路,NOD样受体信号通路等.ToppGene筛选共获得14个弓形虫ROP16Ⅲ致病候选基因,其中C-X-C基序趋化因子配体11(CXCL11)、Toll样受体3(TLR3)、C-C

作者：苏雅静；乔霞；汪澎涛；康宇婷；杨宁爱；贾伟；赵志军

来源：中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2021 年 39卷 4期