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目的 优化硬脑膜蛋白质的提取方法,筛选烟雾病(MMD)病人硬脑膜特异性表达蛋白质.方法 收集96例MMD和13例非MMD病人的硬脑膜组织,用胶原酶Ⅳ孵育去除硬脑膜表面的血液,用机械破碎或液氮研磨方法提取蛋白质,一维凝胶电泳分离后进行质谱鉴定,用同位素相对标记与绝对定量(iTRAQ)技术进行标记、分离和鉴定差异蛋白质,应用R语言和生物信息学分析筛选MMD相关蛋白质,再应用组织芯片技术验证差异蛋白质表达.结果 胶原酶Ⅳ消化、液氮研磨和十二烷基硫酸钠法提取硬脑膜蛋白质效果较好;iTRAQ技术和生信分析发现23个差异蛋白质,组织芯片结果证实MMD病人硬脑膜组织SLC4A1蛋白表达明显下调.结论 iTRAQ技术可以很好地进行标记、分离和鉴定硬脑膜组织差异蛋白质,SLC4A1可能在MMD发病过程中具有一定的作用.

作者:张小军;尹林;刘思远;张丽军

来源:中国临床神经外科杂志 2021 年 26卷 4期

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作者:
张小军;尹林;刘思远;张丽军
来源:
中国临床神经外科杂志 2021 年 26卷 4期
标签:
烟雾病 硬脑膜 蛋白质组 生物信息学 组织芯片 同位素相对标记与绝对定量技术(iTRAQ)
目的 优化硬脑膜蛋白质的提取方法,筛选烟雾病(MMD)病人硬脑膜特异性表达蛋白质.方法 收集96例MMD和13例非MMD病人的硬脑膜组织,用胶原酶Ⅳ孵育去除硬脑膜表面的血液,用机械破碎或液氮研磨方法提取蛋白质,一维凝胶电泳分离后进行质谱鉴定,用同位素相对标记与绝对定量(iTRAQ)技术进行标记、分离和鉴定差异蛋白质,应用R语言和生物信息学分析筛选MMD相关蛋白质,再应用组织芯片技术验证差异蛋白质表达.结果 胶原酶Ⅳ消化、液氮研磨和十二烷基硫酸钠法提取硬脑膜蛋白质效果较好;iTRAQ技术和生信分析发现23个差异蛋白质,组织芯片结果证实MMD病人硬脑膜组织SLC4A1蛋白表达明显下调.结论 iTRAQ技术可以很好地进行标记、分离和鉴定硬脑膜组织差异蛋白质,SLC4A1可能在MMD发病过程中具有一定的作用.