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目的 探讨乳腺癌易感基因相互作用蛋白1(BRIP1)在胶质瘤中的表达及其与病人预后的相关性.方法 从GEO数据库GPL570平台选取三个BRIP1基因表达谱芯片(GSE4290、GSE50161和GSE74195)分析胶质瘤BRIP1的表达情况.使用TC-GA下载有关胶质瘤BRIP1表达、生存率和临床特征的数据,多因素Cox比例回归风险模型分析胶质瘤生存预后的影响因素;利用受试者工作特征(ROC)曲线评估BRIP1表达水平与胶质瘤生存预后的关系;通过基因富集分析胶质瘤BRIP1相关的细胞信号通路.结果 胶质瘤BRIP1表达水平相比于正常样本明显升高(P<0.05).多因素Cox回归分析结果表明,BRIP1高表达(HR=1.250;95%CI:1.056~1.480;P<0.001)是胶质瘤不良预后的独立危险因素.生存曲线分析显示,相较于BRIP1低表达组,BRIP1高表达组胶质瘤生存期明显缩短(P<0.001).ROC曲线分析显示BRIP1表达水平预测胶质瘤1年不良预后的曲线下面积(AUC)为0.744,最佳截断值为0.302,敏感性为0.832,特异性为0.528;预测3年不良预后的AUC为0.801,最佳截断值为0.420,敏感性为0.696,特异性为0.809;预测5年不良预后的AUC为0.767,最佳截断值为0.420时,敏感性为0.593,特异性为0.842.基因富集分析显示BRIP1基因主要富集于DNA复制、同源重组、错配修复和细胞周期等信号转导通路.结论 BRIP

作者:王圣桃;王新庄;高铭;韩大勇

来源:中国临床神经外科杂志 2021 年 26卷 6期

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作者:
王圣桃;王新庄;高铭;韩大勇
来源:
中国临床神经外科杂志 2021 年 26卷 6期
标签:
胶质瘤 乳腺癌易感基因相互作用蛋白1(BRIP1) 预后 生物信息学
目的 探讨乳腺癌易感基因相互作用蛋白1(BRIP1)在胶质瘤中的表达及其与病人预后的相关性.方法 从GEO数据库GPL570平台选取三个BRIP1基因表达谱芯片(GSE4290、GSE50161和GSE74195)分析胶质瘤BRIP1的表达情况.使用TC-GA下载有关胶质瘤BRIP1表达、生存率和临床特征的数据,多因素Cox比例回归风险模型分析胶质瘤生存预后的影响因素;利用受试者工作特征(ROC)曲线评估BRIP1表达水平与胶质瘤生存预后的关系;通过基因富集分析胶质瘤BRIP1相关的细胞信号通路.结果 胶质瘤BRIP1表达水平相比于正常样本明显升高(P<0.05).多因素Cox回归分析结果表明,BRIP1高表达(HR=1.250;95%CI:1.056~1.480;P<0.001)是胶质瘤不良预后的独立危险因素.生存曲线分析显示,相较于BRIP1低表达组,BRIP1高表达组胶质瘤生存期明显缩短(P<0.001).ROC曲线分析显示BRIP1表达水平预测胶质瘤1年不良预后的曲线下面积(AUC)为0.744,最佳截断值为0.302,敏感性为0.832,特异性为0.528;预测3年不良预后的AUC为0.801,最佳截断值为0.420,敏感性为0.696,特异性为0.809;预测5年不良预后的AUC为0.767,最佳截断值为0.420时,敏感性为0.593,特异性为0.842.基因富集分析显示BRIP1基因主要富集于DNA复制、同源重组、错配修复和细胞周期等信号转导通路.结论 BRIP