目的 分析甲状腺乳头状癌(PTC)中长链非编码RNA(lncRNA)的差异表达谱并预测其靶基因.方法 用转录组测序技术对PTC及配对的甲状腺癌旁组织测序,以差异倍数(FC)作为标准筛选差异表达基因,并通过基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)进行靶基因及相关信号通路的分析,以实时荧光定量-PCR法验证筛选的目的lncRNA.结果 共筛选出差异表达的lncRNA 111个(P<0.05);差异表达的mRNA 29个(P<0.05),其中差异显著的lncRNA有18个,上调5个,下调13个(P<0.05).差异表达靶基因主要参与维生素代谢、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)活性的激活和自噬等生物学过程.差异表达靶基因主要与以下几种传导途径相关:"焦粘连""cAMP信号通路""oxylocin信号通路"和"Wnt信号通路".lnc01089-006和MSTRG.277779.1在甲状腺乳头状癌TPC-1细胞中表达下调.结论 lnc01089-006和MSTRG.277779.1及其靶基因以及相关信号通路与甲状腺乳头状癌密切相关.
作者:何亚丽;毛玉娟;申进增;伊琳;顾远辉
来源:中国临床药理学杂志 2021 年 37卷 10期