目的:利用生物信息学技术筛选慢性自发性荨麻疹(CSU)的关键差异表达基因,为研究CSU的生物学机制与治疗靶点提供新的思路.方法:从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库下载GSE72541数据集,使用R语言limma包筛选CSU组与健康对照组间的差异表达基因,并通过cluster-Profiler R包、STRING在线软件、Cytoscape3.8.2软件的MCODE插件分别对差异表达基因的功能、通路富集与蛋白相互作用进行分析.结果:研究发现CSU组与健康对照组共有86个差异表达基因,其中上调基因64个,下调基因22个(|logFC|>1&P.Val<0.05),GO分析显示,差异表达基因主要富集在血小板活化、血液凝固、中性粒细胞脱颗粒等生物过程;KEGG分析显示,主要与造血细胞系、移植物抗宿主病、金黄色葡萄球菌等相关.此外,建立的PPI网络筛选出62个节点及15个关键基因(CXCL10,MMP9,SELP,MME,ITGA2B,ITGB3,CLU,GP6,C5AR1,C6orf25,GP1BB,VWF,CR1,GP9,PLAU).结论:ITGB3,ITGA2B,MMP9及CR1等基因可能与CSU的发病密切相关.
作者：贾秀娟；乌日娜；萨琦拉；王百灵；贺希格图；特格喜白音；郭靖雪；齐宝鹏；木其日
来源：中国麻风皮肤病杂志 2022 年 38卷 6期
