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目的 利用DNA条形码技术对未知鼠种样本进行种类鉴定.方法 以2016年在广东省阳春市捕获的2只鼠样本为研究对象,提取其基因组DNA,采用通用引物BatL5310和R6036R扩增线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因片段并进行测序,将测序结果在美国国立生物技术信息中心(NCBI)中进行BLAST比对,采用邻接法构建分子系统发育树,基于双参数模型计算遗传距离.结果 2只鼠样本的DNA条形码序列一致,为同一种鼠,与NCBI中青毛鼠的序列相似度高达99%,且与青毛鼠(JN105108.1)的遗传距离为0.0046,低于种内遗传距离1%的阈值,因此确认未知鼠为青毛鼠.结论 DNA条形码技术是一种高效、快捷的鼠类鉴定方法,可弥补形态学鉴定缺陷.

作者:姚丹丹;冯志勇;姜洪雪

来源:中国媒介生物学及控制杂志 2018 年 29卷 2期

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作者:
姚丹丹;冯志勇;姜洪雪
来源:
中国媒介生物学及控制杂志 2018 年 29卷 2期
标签:
青毛鼠 DNA条形码 细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因
目的 利用DNA条形码技术对未知鼠种样本进行种类鉴定.方法 以2016年在广东省阳春市捕获的2只鼠样本为研究对象,提取其基因组DNA,采用通用引物BatL5310和R6036R扩增线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因片段并进行测序,将测序结果在美国国立生物技术信息中心(NCBI)中进行BLAST比对,采用邻接法构建分子系统发育树,基于双参数模型计算遗传距离.结果 2只鼠样本的DNA条形码序列一致,为同一种鼠,与NCBI中青毛鼠的序列相似度高达99%,且与青毛鼠(JN105108.1)的遗传距离为0.0046,低于种内遗传距离1%的阈值,因此确认未知鼠为青毛鼠.结论 DNA条形码技术是一种高效、快捷的鼠类鉴定方法,可弥补形态学鉴定缺陷.