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目的 调查云南省楚雄市肾综合征出血热(HFRS)流行特征、鼠类分布及其携带汉坦病毒(HV)的分子进化特征.方法 收集HFRS病例资料,采用描述流行病学方法进行分析.用笼夜法捕鼠,计算鼠种构成比和鼠密度.鼠肺标本用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)检测HV核酸及L基因部分片段,并进行序列测定,使用ClastalX 1.83和MEGA 6.0等生物信息学软件进行HV同源性分析和构建系统进化树.结果 2015-2018年楚雄市共报告HFRS病例186例,年平均发病率为7.74/10万.楚雄市14个乡镇均有HFRS病例报告,其中鹿城和东瓜镇发病数占发病总数的75.27%(140/186),为主要流行区.全年各月均有病例发生,男女性别比例为2.1∶1,以青壮年和农民居多.2015-2018年的5-10月在楚雄市居住区共捕获鼠类3种1 053只,其中褐家鼠、黄胸鼠和斯氏家鼠的构成比依次为97.06%、1.80%和1.14%,鼠密度依次为2.57%、0.05%和0.03%,以鹿城和东瓜镇褐家鼠密度最高(3.09%).2016年在楚雄市采获的50只褐家鼠肺脏组织标本经RT-PCR检测,HV核酸阳性2份(CX04-06和CX07-09),带病毒率为4.00%.L基因部分序列同源性分析表明,CX04-06和CX07-09病毒株与8株HV汉城型病毒(SEOV)的核苷酸同源性为72.34%~93.52%,其中,与云南省祥云县DLR2株和老挝L0199株同源性最高(92.39%~93.52

作者:胡挺松;胡秋凌;李绍雄;黄勇;胡海梅;高丽芬;罗琼梅;何永芝;周永存;张海林;张富强

来源:中国媒介生物学及控制杂志 2020 年 31卷 2期

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作者:
胡挺松;胡秋凌;李绍雄;黄勇;胡海梅;高丽芬;罗琼梅;何永芝;周永存;张海林;张富强
来源:
中国媒介生物学及控制杂志 2020 年 31卷 2期
标签:
肾综合征出血热 流行特征 啮齿动物 汉坦病毒 同源性分析 进化分析
目的 调查云南省楚雄市肾综合征出血热(HFRS)流行特征、鼠类分布及其携带汉坦病毒(HV)的分子进化特征.方法 收集HFRS病例资料,采用描述流行病学方法进行分析.用笼夜法捕鼠,计算鼠种构成比和鼠密度.鼠肺标本用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)检测HV核酸及L基因部分片段,并进行序列测定,使用ClastalX 1.83和MEGA 6.0等生物信息学软件进行HV同源性分析和构建系统进化树.结果 2015-2018年楚雄市共报告HFRS病例186例,年平均发病率为7.74/10万.楚雄市14个乡镇均有HFRS病例报告,其中鹿城和东瓜镇发病数占发病总数的75.27%(140/186),为主要流行区.全年各月均有病例发生,男女性别比例为2.1∶1,以青壮年和农民居多.2015-2018年的5-10月在楚雄市居住区共捕获鼠类3种1 053只,其中褐家鼠、黄胸鼠和斯氏家鼠的构成比依次为97.06%、1.80%和1.14%,鼠密度依次为2.57%、0.05%和0.03%,以鹿城和东瓜镇褐家鼠密度最高(3.09%).2016年在楚雄市采获的50只褐家鼠肺脏组织标本经RT-PCR检测,HV核酸阳性2份(CX04-06和CX07-09),带病毒率为4.00%.L基因部分序列同源性分析表明,CX04-06和CX07-09病毒株与8株HV汉城型病毒(SEOV)的核苷酸同源性为72.34%~93.52%,其中,与云南省祥云县DLR2株和老挝L0199株同源性最高(92.39%~93.52