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目的 探讨淡色库蚊溴氰菊酯敏感品系与抗性种群成蚊肠道菌群多样性和组成结构.方法 分离淡色库蚊溴氰菊酯敏感品系与抗性种群成蚊肠道并提取总基因组DNA,对敏感品系与抗性种群成蚊肠道菌群16S rDNA基因的V3+V4区进行测序,分析其物种组成结构、菌群多样性及相对丰度;通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术验证细菌相对丰度以检测测序数据的可靠性.结果 通过优化剪切得到216022条有效序列,根据序列相似性进行聚类分析共获取766个操作分类单元,分别注释到31个门,62个纲,132个目,215个科和339个属.样本覆盖度均接近99%,表明测序量基本覆盖所有细菌物种.敏感品系的Chao1指数、香农指数和辛普森指数分别为374.53±40.27、2.56±0.59和0.36±0.11,抗性种群分别为201.58±29.34、1.14±0.13和0.55±0.07.淡色库蚊敏感品系与抗性种群肠道菌群均以变形菌门和厚壁菌门居多;在目分类水平上,敏感品系的优势菌目分别为红螺菌目、肠杆菌目及伯克霍尔德氏菌目,而抗性种群的优势菌目为红螺菌目、气单胞菌目及乳酸杆菌目;在属分类水平上,敏感品系的优势菌属为未鉴定属的醋酸杆菌科,其次是朝井杆菌属与红球菌属,而朝井杆菌属以绝对优势作为抗性种群的优势菌属,其次是未鉴定属的醋酸杆菌科与气单胞菌属.随机挑选细菌的RT-qPCR结

作者:刘芷涵;孙小红;邢一帆;周丹;孙艳;马磊;沈波

来源:中国媒介生物学及控制杂志 2020 年 31卷 5期

知识库介绍

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作者:
刘芷涵;孙小红;邢一帆;周丹;孙艳;马磊;沈波
来源:
中国媒介生物学及控制杂志 2020 年 31卷 5期
标签:
淡色库蚊 溴氰菊酯 肠道微生物 多样性 16S rDNA
目的 探讨淡色库蚊溴氰菊酯敏感品系与抗性种群成蚊肠道菌群多样性和组成结构.方法 分离淡色库蚊溴氰菊酯敏感品系与抗性种群成蚊肠道并提取总基因组DNA,对敏感品系与抗性种群成蚊肠道菌群16S rDNA基因的V3+V4区进行测序,分析其物种组成结构、菌群多样性及相对丰度;通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术验证细菌相对丰度以检测测序数据的可靠性.结果 通过优化剪切得到216022条有效序列,根据序列相似性进行聚类分析共获取766个操作分类单元,分别注释到31个门,62个纲,132个目,215个科和339个属.样本覆盖度均接近99%,表明测序量基本覆盖所有细菌物种.敏感品系的Chao1指数、香农指数和辛普森指数分别为374.53±40.27、2.56±0.59和0.36±0.11,抗性种群分别为201.58±29.34、1.14±0.13和0.55±0.07.淡色库蚊敏感品系与抗性种群肠道菌群均以变形菌门和厚壁菌门居多;在目分类水平上,敏感品系的优势菌目分别为红螺菌目、肠杆菌目及伯克霍尔德氏菌目,而抗性种群的优势菌目为红螺菌目、气单胞菌目及乳酸杆菌目;在属分类水平上,敏感品系的优势菌属为未鉴定属的醋酸杆菌科,其次是朝井杆菌属与红球菌属,而朝井杆菌属以绝对优势作为抗性种群的优势菌属,其次是未鉴定属的醋酸杆菌科与气单胞菌属.随机挑选细菌的RT-qPCR结