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目的 探究调控恶性黑素瘤转移的lncRNA-TF-mRNA分子网络,寻找预后相关标志物.方法 下载TCGA数据库中皮肤恶性黑素瘤样本转录组数据,筛选在转移样本中高表达的lncRNA、TF与mRNA,进行相关性分析及预测,绘制互作网络.最后通过多因素COX回归,构建预后模型,寻找预后标志物.结果 共鉴定出2 719个差异基因,其中1 920个在转移样本中高表达,转移样本中高表达基因富集到与免疫衰竭相关的通路,并构建lncRNA-TF-mRNA分子调控网络与调控网络的预后模型.结论 LINC00402、LINC00528被认为是影响预后的危险因素,LINC00582、TBX21是影响预后的保护因素,以上因子不仅可能作为提示恶性黑素瘤转移潜力的标志物,也可能作为预测恶性黑素瘤患者预后风险的标志物.

作者:贺赞;张婷;朱文巍;柏佳;张晓宁;杨洁;赵华

来源:中国煤炭工业医学杂志 2021 年 24卷 2期

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作者:
贺赞;张婷;朱文巍;柏佳;张晓宁;杨洁;赵华
来源:
中国煤炭工业医学杂志 2021 年 24卷 2期
标签:
长链非编码RNA 转录因子 恶性黑素瘤
目的 探究调控恶性黑素瘤转移的lncRNA-TF-mRNA分子网络,寻找预后相关标志物.方法 下载TCGA数据库中皮肤恶性黑素瘤样本转录组数据,筛选在转移样本中高表达的lncRNA、TF与mRNA,进行相关性分析及预测,绘制互作网络.最后通过多因素COX回归,构建预后模型,寻找预后标志物.结果 共鉴定出2 719个差异基因,其中1 920个在转移样本中高表达,转移样本中高表达基因富集到与免疫衰竭相关的通路,并构建lncRNA-TF-mRNA分子调控网络与调控网络的预后模型.结论 LINC00402、LINC00528被认为是影响预后的危险因素,LINC00582、TBX21是影响预后的保护因素,以上因子不仅可能作为提示恶性黑素瘤转移潜力的标志物,也可能作为预测恶性黑素瘤患者预后风险的标志物.