目的 构建食管鳞癌lncRNA差异表达谱,并进行共表达关联分析.方法 选取2015年6-9月在安阳市肿瘤医院胸外科行食管癌根治术的6例食管鳞癌患者为研究对象,取食管鳞癌组织及匹配的癌旁正常组织,采用微阵列分析食管鳞癌lncRNA和mRNA差异表达谱,进行共表达关联分析、靶基因预测、转录因子预测,以及基因本体论(GO)、通路(Pathway)和疾病(Disease)富集分析.结果 共筛选出差异表达lncRNA 2 052个,其中670个上调,1 382个下调;差异表达mRNA 3 240个,1 732个上调,1 508个下调(差异倍数为2倍以上变化且P＜0.05).共表达关联分析显示lncRNA与mRNA可形成复杂的调控网络.靶基因预测结果显示,共有792个差异表达lncRNA通过顺式和反式2种方式调控靶基因,410个lncRNA有cis-调控的靶基因,370个lncRNA有rans-调控的靶基因,12个lncRNA同时有cis-和trans-调控的靶基因.GO分析结果显示,lncRNA可能调控的靶基因主要参与细胞过程、单组织过程和代谢过程等生物过程,黏合、催化活性和分子功能调节剂等分子功能,细胞器、细胞和细胞组分等细胞成分;Pathway分析显示,靶基因主要参与叶酸单碳池、补体和凝血级联和o-糖生物合成等通路.Disease分析显示,靶基因可能参与少淋巴细胞综合征(BLS)1型、进行性肌阵挛性癫痫、口腔和牙齿疾病以及局部常
作者：张耀文；郑安平；周福有；郝安林；冯连杰；代宁涛；祖玲玲；徐瑞平
来源：中国慢性病预防与控制 2020 年 28卷 2期
